自然人独资公司的法定代表人不一定是控制公司的人，但通常情况下法定代表人会由实际控制人担任，不过也存在例外情况。以下从不同角度为你详细分析：

从公司治理结构角度

在自然人独资公司中，公司的唯一股东是该自然人，股东对公司拥有绝对的控制权。股东可以通过制定公司章程、选举董事和监事等方式来行使自己的控制权。而法定代表人是由公司章程规定并由公司登记机关登记的，代表公司行使职权的人。在很多情况下，自然人独资公司的唯一股东会同时担任公司的法定代表人，这样便于其直接管理公司事务，行使控制权。例如，张三设立了一家自然人独资的贸易公司，他作为唯一股东，在公司章程中规定自己担任法定代表人，这样张三就可以直接以法定代表人的身份对外签订合同、处理公司日常经营事务等，实现对公司的控制。

然而，也存在唯一股东不担任法定代表人的情况。股东可能出于各种原因，如自身精力有限、专业能力不足等，委托其他人担任公司的法定代表人。比如，李四设立了一家自然人独资的科技公司，他虽然拥有公司的绝对控制权，但由于自己不擅长技术管理和对外商务洽谈，便委托了公司的一位技术骨干王五担任法定代表人，由王五代表公司处理相关事务，但公司的重大决策权仍掌握在李四手中。

从法律责任角度

法定代表人作为公司的代表，需要承担一定的法律责任。如果公司的行为违反了法律法规，法定代表人可能会面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。例如，公司因环境污染问题被环保部门处罚，法定代表人可能会被处以罚款；如果公司因合同纠纷被起诉，法定代表人可能需要代表公司出庭应诉；在极端情况下，如果公司涉及犯罪行为，法定代表人可能会被追究刑事责任。因此，有些自然人独资公司的股东为了避免承担过多的法律风险，可能不会亲自担任法定代表人，而是选择一个相对可靠的人来担任。

从实际控制权认定角度

判断一个人是否控制公司，不能仅仅依据其是否担任法定代表人。实际控制权的认定需要综合考虑多个因素，如是否拥有公司的决策权、是否能够支配公司的财务和人事等。即使一个人不是公司的法定代表人，但如果他通过股权控制、协议安排等方式实际支配公司的行为，那么他仍然可以被认定为公司的实际控制人。例如，赵六设立了一家自然人独资的投资公司，他委托了钱七担任法定代表人，但赵六通过与钱七签订内部协议的方式，约定了公司的重大投资决策必须经过他的同意，公司的财务收支也由他进行监管，在这种情况下，赵六仍然是公司的实际控制人。

给你的建议：如果你作为自然人独资公司的股东，想要确保自己对公司的控制权，同时又要合理规避法律风险，可以在公司章程中明确规定自己的决策权和监督权，并通过与法定代表人签订内部协议的方式，对法定代表人的职权进行限制和约束。如果你对公司的控制权问题存在疑问，或者遇到了相关的法律纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。