结论：在被执行人有公司和个人，且自然人的财产已被处分的情况下，是否适用参与分配制度，需根据具体情况来判断。

分析：

1. 参与分配制度的基本概念：

   • 参与分配制度是指在执行过程中，因债务人财产不足以清偿所有债权，而允许其他债权人参与分配已执行财产的制度。这一制度主要适用于自然人或其他组织作为被执行人的情况。

2. 自然人财产被处分的情况：

   • 若自然人的财产已被处分，且处分所得款项已用于清偿部分或全部债务，那么对于剩余未清偿的债务，其他债权人是否可以参与分配，取决于多个因素。
   • 首先，需要确认被处分的财产是否属于被执行人的责任财产，即是否可用于清偿债务。
   • 其次，要查看执行程序是否已终结，或者是否还有剩余财产可供分配。

3. 公司财产与个人财产的区分：

   • 在被执行人既有公司又有个人的情况下，需要明确区分公司财产和个人财产。公司财产属于公司所有，个人财产属于个人所有，两者在法律上是独立的。
   • 如果自然人的财产已被处分，且该财产属于个人财产，那么公司财产（如果存在且未被处分）通常不会直接用于清偿该自然人的个人债务，除非存在法律上的特殊情形（如公司财产与个人财产混同）。

4. 适用参与分配制度的条件：

   • 通常情况下，如果自然人的财产已被处分，且处分所得已用于清偿债务，那么对于剩余债务，其他债权人要参与分配，需要满足以下条件：
     • 执行程序尚未终结；
     • 存在剩余财产可供分配；
     • 其他债权人符合参与分配的条件（如已取得执行依据等）。
   • 如果公司财产未被处分，且公司作为独立法人存在，那么公司财产通常不会直接纳入自然人的参与分配程序中，除非公司也作为被执行人且其财产被一并执行。

5. 特殊情况考虑：

   • 如果存在公司财产与个人财产混同的情况，或者公司作为被执行人且其财产不足以清偿债务，而自然人作为公司股东或关联方存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务的情形，那么可能适用“法人人格否认”制度，将公司财产与个人财产视为一体进行清偿。在这种情况下，其他债权人可能有机会参与分配原本属于公司的财产。

建议：

• 对于具体案件，建议详细审查执行程序、财产处分情况、公司财产与个人财产的区分以及是否存在特殊情形等因素。
• 如果涉及复杂法律问题或存在争议点，建议及时咨询专业律师（即我本人，陈晓辉律师，专注于公司事务、股权转让领域），以便获得更准确、全面的法律意见。

后续行动：

• 如果您有具体的案件情况或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。