结论前置：能否起诉对方的网店来追讨欠款，主要取决于网店的经营性质以及债务产生的具体情况。一般情况下，不能直接起诉网店，但可以根据网店的经营性质，将相关的经营者或企业列为被告来提起诉讼。
详细分析：
网店经营性质的影响：
- 个体工商户：如果网店是以个体工商户的形式经营，且债务是因个体工商户的经营活动产生的，那么根据《民法典》的相关规定，个体工商户的债务由个人财产或家庭财产承担。此时，你可以将个体工商户登记的经营者列为被告，如果网店有字号，起诉状中应注明字号。
- 个人独资企业：对于个人独资企业形式的网店，由于其财产与投资人财产密切相关，投资人对企业债务承担无限责任。因此，如果是个人独资企业欠款不还，你可以将该个人独资企业以及其投资人列为共同被告。
- 合伙企业：在合伙企业形式的网店中，合伙人对合伙债务承担连带责任。如果是合伙企业欠款不还，你可以起诉合伙企业以及全体普通合伙人。有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担责任，但在某些特定情况下也可能被列为共同被告。
- 公司：如果网店是以公司形式存在，公司是独立的法人，具有独立的财产和民事责任能力。公司债务通常由公司以其全部财产独立承担责任。若欠款是公司的债务，你只能起诉公司，而不能直接起诉公司背后的股东。但在股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任等法定情形下，你可以要求股东对公司债务承担连带责任。
债务产生的具体情况：
- 除了网店的经营性质，债务产生的具体情况也是决定能否起诉网店的重要因素。如果债务是因网店的经营活动产生的，那么与网店的经营性质相关的上述分析将适用。但如果债务是因个人行为产生的，比如个人借款用于非网店经营活动，那么起诉的对象将是个人，而不是网店。
特殊约定情况：
- 如果在借款或交易过程中，你与对方有明确的约定（如以网店作为还款的担保），并且在债务人未履行还款义务时，你可能有权依据约定对网店进行处置。但这种情况需要双方有明确的书面协议，并且协议内容符合法律规定。
网上起诉流程（若决定起诉）：
如果你决定通过法律途径追讨欠款，且符合网上起诉的条件，可以按照以下流程进行：
- 收集证据：包括借条、借款合同、转账记录、聊天记录等能证明借贷关系存在的文件。
- 确定管辖法院：一般遵循“原告就被告”原则，即向被告住所地人民法院提起诉讼；若被告住所地与经常居住地不一致，则由经常居住地法院管辖。根据借款合同的约定来确定管辖法院也是一种方式。
- 撰写起诉状：明确原被告信息、诉讼请求（欠款金额及利息等）、事实与理由（借款经过、未还款情况等）。
- 网上立案：通过法院官方网站或移动司法服务平台进行网上立案，填写相关信息并上传诉讼材料。
- 等待审核与反馈：法院会对提交的申请进行审核，若申请材料齐全、符合法定形式，法院会予以受理；若存在问题，则会通知补正或说明情况。
- 参与诉讼活动：根据法院要求，可能需要参与线下庭审或其他诉讼活动。
建议：
在追讨欠款时，应首先明确债务的性质、产生原因以及债务人与网店之间的关系。根据具体情况选择合适的被告提起诉讼，并准备好充分的证据材料。如果你对整个流程或具体操作有疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的指导和帮助。