在破产抵销权行使后的诉讼费负担问题上，一般原则是由债务人（即破产公司或企业）的财产来承担，但具体承担情况需根据案件的具体事实和法院的判决来确定。以下是对此问题的详细分析：
一般原则下的诉讼费承担：
- 根据《诉讼费用交纳办法》及相关破产法规定，破产案件的受理费通常视为破产费用的一部分，由债务人财产来承担。这包括破产抵销权行使后可能产生的诉讼费用。破产费用是为了全体债权人的共同利益以及破产程序顺利进行而支付的必要费用，因此，在一般情况下，诉讼费用会由债务人财产来支付。
特殊情况下的诉讼费承担：
- 原告过错导致：如果原告在诉讼过程中存在过错，如提出无根据的诉讼请求、未按时缴纳诉讼费用等，导致诉讼失败或产生额外费用，法院可能会根据具体情况判决原告承担相应的诉讼费用。
- 债务人财产不足：当债务人的财产不足以清偿所有破产费用和共益债务时，诉讼费用可能会按照一定比例进行清偿，或者在某些情况下，可能无法得到全额清偿。此时，债权人已缴纳的诉讼费用可能无法退回，或者只能得到部分退回。
- 法院判决：最终诉讼费用的承担还取决于法院的判决。法院会根据案件的具体情况，包括双方当事人的过错程度、诉讼请求的合理性等因素，来判决诉讼费用的承担方。
实际操作中的建议：
- 保留证据：在破产抵销权行使过程中，双方当事人应保留好相关证据，如合同、交易记录、对账单等，以便在诉讼中证明自己的主张。
- 咨询专业律师：由于破产案件涉及复杂的法律关系和财产分配问题，建议当事人在行使破产抵销权或面临诉讼时，及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
- 关注法院判决：在诉讼过程中，当事人应密切关注法院的判决和裁定，及时了解诉讼费用的承担情况，并采取相应的措施来维护自己的合法权益。
总结来说，破产抵销权行使后的诉讼费负担问题并非一成不变，而是需要根据案件的具体情况来判断。如果您面临这样的问题，建议直接向我咨询，我会根据您的具体案情，为您提供针对性的法律分析和解决方案。