政府采购合同双方经协商一致，是可以减少合同金额的，但这一行为需遵循相关法律法规的规定，并确保程序的合法性与合规性。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律依据与合同变更原则
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第五百四十三条，当事人协商一致，可以变更合同。这意味着，在政府采购合同中，如果双方当事人（即采购人和供应商）经过友好协商并达成一致意见，是可以对合同内容进行变更的，包括减少合同金额。
合同变更的合法性与合规性：
- 合同变更必须遵循合法、合规的原则。在政府采购领域，由于涉及公共资金的使用，合同变更还需符合政府采购的相关法律法规和政策要求，如《中华人民共和国政府采购法》及其实施条例等。
二、政府采购合同变更的特殊要求
变更程序的规范性：
- 政府采购合同的变更通常需要经过一定的程序，如提交变更申请、审核批准等。这些程序旨在确保合同变更的合法性和合规性，防止滥用变更权或损害公共利益。
- 具体来说，采购人可能需要向财政部门或相关主管部门提交合同变更申请，说明变更的原因、内容、影响等，并附上相关证明材料。财政部门或相关主管部门在审核后，会作出是否批准变更的决定。
变更内容的合理性：
- 合同变更的内容应当合理、必要，且不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。在减少合同金额的情况下，采购人需要确保变更后的合同仍然能够满足采购需求，且不会对供应商造成不公平的待遇。
三、实际操作中的注意事项
协商一致与书面确认：
- 双方当事人在协商减少合同金额时，应当确保达成一致意见，并最好以书面形式进行确认。这有助于避免后续因理解不一致而产生的纠纷。
及时履行变更程序：
- 在达成一致意见后，采购人应及时按照相关规定履行合同变更程序，确保变更的合法性和有效性。
关注变更后的合同履行：
- 合同变更后，双方当事人应继续按照变更后的合同内容履行各自的义务。采购人应关注供应商是否按照变更后的合同金额提供相应的货物或服务，确保采购目标的实现。
四、法律后果与风险提示
合法变更的法律后果：
- 如果政府采购合同的变更符合法律法规和政策要求，且程序合法、内容合理，那么变更后的合同对双方当事人具有法律约束力。双方应继续按照变更后的合同内容履行各自的义务。
违法变更的法律风险：
- 如果合同变更违反了相关法律法规或政策要求，或者程序不合法、内容不合理，那么变更可能无效。在这种情况下，双方当事人可能需要承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复原状等。
建议：在政府采购合同中减少合同金额时，务必确保双方协商一致，并遵循相关法律法规和政策要求，履行必要的变更程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。