在合同纠纷中，关于合同原件的留存，并没有一个固定的法律规定必须由甲方或乙方留存，这主要取决于双方的约定以及实际交易习惯和需要。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 双方约定优先：

   • 合同是双方意思表示一致的产物，因此，合同中关于原件留存的约定具有优先效力。如果合同中明确规定了原件由哪一方留存，那么双方应当遵循这一约定。
   • 例如，合同中可能约定“本合同一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力”，这样的约定就明确了双方都有留存原件的权利和义务。

2. 实际交易习惯和需要：

   • 在没有明确约定的情况下，原件的留存可能取决于实际的交易习惯和需要。例如，在某些交易中，由于一方需要频繁使用合同作为交易凭证或进行后续操作，因此可能更倾向于留存原件。
   • 另一方面，如果合同涉及多方参与或复杂交易结构，可能也需要考虑原件的留存方式以确保所有相关方都能方便地查阅和使用合同。

3. 法律后果与风险防范：

   • 留存合同原件对于维护自身权益具有重要意义。在发生纠纷时，原件是证明合同关系、履行情况等事实的关键证据。因此，无论甲方还是乙方，都应当重视合同原件的留存。
   • 如果一方未能留存原件或原件丢失、损毁，可能在纠纷中处于不利地位。因此，建议双方在签订合同时就明确原件的留存方式，并在交易过程中妥善保管原件。

4. 实际操作建议：

   • 在签订合同时，双方可以协商确定原件的留存方式，并在合同中明确约定。例如，可以约定由一方留存原件，另一方留存复印件并加盖公章或签字确认其真实性。
   • 在交易过程中，双方应当妥善保管合同原件，避免丢失、损毁或泄露给无关第三方。如果可能的话，可以将原件存放在安全的地方，如保险柜或银行保险箱等。

总结来说，合同原件的留存并没有固定的法律规定，而是取决于双方的约定以及实际交易习惯和需要。为了维护自身权益和避免纠纷，建议双方在签订合同时就明确原件的留存方式，并在交易过程中妥善保管原件。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。