可以起诉商家。针对电动三轮车合格证是假的情况，以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与依据
根据《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，生产者、销售者应当保证其生产、销售的产品符合保障人体健康和人身、财产安全的国家标准、行业标准。如果产品存在缺陷或者不符合相关标准，给消费者造成损害的，生产者、销售者应当承担赔偿责任。合格证作为产品符合相关标准的重要证明文件，如果其是假的，那么可以合理推断该产品可能存在质量问题或者不符合相关标准。
起诉商家的理由
欺诈行为：商家提供假的合格证，可能构成欺诈行为。根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的规定，经营者提供商品或者服务有欺诈行为的，应当按照消费者的要求增加赔偿其受到的损失，增加赔偿的金额为消费者购买商品的价款或者接受服务的费用的三倍；增加赔偿的金额不足五百元的，为五百元。因此，你可以以商家欺诈为由，要求商家承担赔偿责任。
产品质量问题：即使商家不构成欺诈，但如果电动三轮车确实存在质量问题或者不符合相关标准，导致你遭受了损失（如人身伤害、财产损失等），你也可以根据《中华人民共和国产品质量法》的规定，要求商家承担赔偿责任。
起诉流程与建议
收集证据：在起诉之前，你需要收集相关证据来证明商家提供了假的合格证以及电动三轮车存在质量问题或者不符合相关标准。这些证据可以包括购买合同、发票、合格证、产品照片、检测报告等。
咨询律师：虽然你可以自行起诉商家，但考虑到法律程序的复杂性和专业性，建议你咨询一位专业律师来协助你处理此事。律师可以帮助你分析案情、制定诉讼策略、准备诉讼材料等。
提起诉讼：在收集到足够证据并咨询律师后，你可以向法院提起诉讼，要求商家承担赔偿责任。在诉讼过程中，你需要按照法院的要求提交相关证据和材料，并参加庭审等诉讼活动。
可能的法律后果
如果法院认定商家确实存在欺诈行为或者产品质量问题，并判决商家承担赔偿责任，那么商家需要按照判决结果向你支付赔偿金。如果商家拒不履行判决结果，你还可以向法院申请强制执行。
行动建议：如果你遇到了电动三轮车合格证是假的情况，并因此遭受了损失，建议你及时收集证据并咨询专业律师（即我），以便更好地维护自己的合法权益。