结论：三方物流调度员从中抽取信息费是否合法，需根据具体情况判断，包括抽取信息费的行为性质、是否违反合同约定或法律规定等。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度：
- 若合同中有明确约定：如果三方物流合同中明确规定了调度员可以抽取一定比例的信息费作为服务报酬，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么调度员抽取信息费的行为是合法的。
- 若合同中无明确约定：如果合同中没有明确约定调度员可以抽取信息费，那么调度员擅自抽取信息费可能构成违约行为，需要承担相应的违约责任。
法律规定角度：
- 合法性原则：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，民事主体从事民事活动应当遵循合法原则，不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果调度员抽取信息费的行为违反了相关法律法规，如构成不正当竞争、商业贿赂等，那么该行为就是违法的。
- 职务行为性质：调度员作为物流公司的一员，其抽取信息费的行为如果被视为职务行为，那么该行为是否合法还需考虑物流公司的相关规定和授权。如果物流公司明确禁止调度员抽取信息费，而调度员仍然擅自抽取，那么该行为不仅违反了物流公司的规定，也可能构成违法行为。
实际操作与行业惯例角度：
- 行业惯例：在某些物流行业中，调度员抽取一定比例的信息费可能被视为行业惯例或潜规则。然而，即使存在这样的惯例，也不能成为调度员擅自抽取信息费的合法依据。如果合同中没有明确约定或法律法规没有相关规定，调度员仍然擅自抽取信息费，那么该行为仍然可能构成违约或违法行为。
- 实际操作中的合理性：在实际操作中，调度员抽取信息费的行为是否合理还需考虑多种因素，如信息费的金额、抽取方式、对物流公司和其他方的影响等。如果信息费金额过高、抽取方式不透明或对物流公司和其他方造成了不利影响，那么该行为可能被视为不合理或违法。
法律建议：
- 对于物流公司而言，应明确合同中关于调度员抽取信息费的约定，避免产生纠纷。同时，应加强对调度员的培训和管理，确保其行为符合法律法规和公司规定。
- 对于调度员而言，应遵守合同约定和法律法规，不得擅自抽取信息费。如果认为自己的劳动报酬不合理或存在其他纠纷，应通过合法途径解决，如与物流公司协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
- 对于其他相关方而言，如发现调度员擅自抽取信息费的行为，应及时向物流公司反映或向相关部门举报，以维护自身合法权益和市场秩序。
可能法律后果：
- 如果调度员擅自抽取信息费的行为构成违约或违法，可能需要承担违约责任、行政责任甚至刑事责任。具体后果取决于行为的性质、情节和后果等因素。
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