针对您提出的“串标工程已经竣工怎么处罚”的问题，这是一个涉及招投标法律法规的严肃议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、处罚的法律依据
根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条的规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，无论工程是否已经竣工，相关责任主体都将受到法律的严厉处罚。这包括罚款、取消投标资格、吊销营业执照，甚至可能承担刑事责任。
二、具体处罚措施
行政处罚：
- 罚款：对参与串标的单位和个人，将处以中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，还将处以单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。
- 取消投标资格：情节严重的，将取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格，并予以公告。
- 吊销营业执照：对于构成严重违法的企业，可能面临吊销营业执照的处罚，这将严重影响企业的正常运营。
刑事责任：
- 如果串标行为构成犯罪，如串通投标罪等，相关责任人员将依法承担刑事责任，可能面临有期徒刑、拘役和罚金等刑罚。
民事赔偿：
- 串标行为给其他投标人或招标人造成损失的，应依法承担赔偿责任。这包括因串标导致的工程质量问题、工期延误等直接和间接损失。
其他处罚：
- 对于存在串标行为的招标代理机构，可能会面临暂停直至取消招标代理资格的处罚。
- 相关不良行为记录将被记入信用档案，并向社会公布，这将影响企业的信誉和未来的招投标活动。
三、处理流程与建议
收集证据：
- 在发现串标行为后，应立即收集相关证据，包括招投标文件、交易记录、沟通记录等，以证明串标行为的存在。
向相关部门举报：
- 根据工程性质，向对应的行政监督部门（如住房和城乡建设部门、水行政主管部门等）或招投标管理机构举报，并提供详实证据。
配合调查：
- 在相关部门展开调查时，应积极配合，提供必要的协助和信息，以确保调查的顺利进行。
依法维权：
- 如果因串标行为受到损失，应依法寻求民事赔偿，维护自身合法权益。
四、特别提醒
- 及时行动：发现串标行为后应尽快采取措施，以免证据灭失或时效过期。
- 全面调查：确保调查过程全面、细致，不留死角，以充分揭露串标行为。
- 依法处理：在处理过程中要严格遵守法律法规，确保程序合法、结果公正。
综上所述，串标工程已经竣工并不意味着相关责任主体可以逃避法律处罚。无论工程是否已经竣工，只要发现串标行为，都将依法受到严厉处罚。因此，我建议您在发现串标行为后，立即采取行动，收集证据并向相关部门举报，以维护招投标的公平、公正和透明原则。