农民在租用国家土地上修路收取过路费的行为，一般是不合法的。以下从几个角度进行详细分析：
一、土地租用与修路的合法性前提
土地租用合法性：
- 农民若要租用国家土地，必须基于合法、合规的程序，与土地管理部门或相关权利人签订租赁合同，并明确租赁用途、期限、租金等条款。
- 未经合法审批或未签订合法租赁合同，擅自租用国家土地是违法的。
修路合法性：
- 修路属于公共基础设施建设，通常需要经过相关部门的规划、审批，并符合土地利用总体规划和年度计划。
- 若修路项目未经合法审批，或不符合规划要求，则修路行为本身也是违法的。
二、收取过路费的合法性分析
道路性质决定收费合法性：
- 如果修路是为了公共利益，如连接村庄、方便村民出行等，那么这条道路通常被视为公共道路，其使用应免费向公众开放。
- 在这种情况下，农民作为道路的建设者或使用者，无权擅自收取过路费。
收费需合法授权：
- 即便道路并非完全公共性质，如属于特定区域内的内部道路，农民若想收取过路费，也必须获得相关部门的合法授权，如政府批准、物价部门定价等。
- 未经合法授权擅自收费，可能构成违法收费行为，面临法律制裁。
三、可能涉及的法律后果
行政处罚：
- 若农民擅自租用国家土地修路并收取过路费，可能面临土地管理部门的行政处罚，如责令停止违法行为、恢复土地原状、罚款等。
民事纠纷：
- 擅自收费可能引发与过往车辆或行人的民事纠纷，如被要求退还非法收取的费用、赔偿因收费导致的损失等。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果农民的行为构成诈骗、敲诈勒索等犯罪行为，还可能面临刑事责任的追究。
四、建议与注意事项
合法租用土地：
- 农民若需租用国家土地修路，应首先与土地管理部门或相关权利人协商，签订合法租赁合同，并明确租赁用途和期限。
遵守规划审批：
- 修路项目应符合相关规划和审批要求，确保项目的合法性和合规性。
避免擅自收费：
- 除非获得合法授权，否则农民应避免擅自收取过路费，以免引发法律纠纷和承担法律责任。
咨询专业意见：
- 在涉及土地租用、修路和收费等复杂法律问题时，建议农民咨询专业律师或相关部门的意见，以确保自身行为的合法性和合规性。
综上所述，农民在租用国家土地上修路收取过路费的行为一般是不合法的。为了确保自身行为的合法性和避免法律风险，农民应遵守相关法律法规和程序要求，在合法合规的前提下进行土地租用和修路活动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。