在机动车与非机动车发生事故且双方负同等责任的情况下，非机动车人员的医疗费保险是否会赔偿，需分情况讨论：

1. 交强险赔偿范围：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条及《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条，机动车需投保交强险。在事故中，若非机动车人员受伤，交强险将在医疗费用赔偿限额内（如18000元，具体以最新规定为准）进行赔偿。这一赔偿是不考虑事故责任的，即无论非机动车人员是否有过错，交强险都会在限额内进行赔偿。

2. 超出交强险赔偿限额的部分：

   • 若非机动车人员的医疗费超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分将由双方按照各自的责任比例来分担。在同等责任的情况下，双方将各自承担超出部分医疗费的50%。
   • 具体计算：假设非机动车人员的医疗费总额为X元，交强险赔偿了Y元（Y≤18000元），那么超出部分为(X-Y)元。双方各自承担的金额为(X-Y)/2元。

3. 保险公司的角色：

   • 对于机动车方而言，其投保的交强险和可能的商业三者险将在赔偿过程中发挥作用。交强险先赔，不足部分由商业三者险按照合同约定进行赔偿。若仍有不足，则由机动车方自行承担。
   • 对于非机动车方而言，若其也投保了相关保险（如非机动车第三者责任险，但此类保险并不常见），则也可能在赔偿过程中发挥作用。不过，在大多数情况下，非机动车方主要依赖机动车方的保险进行赔偿。

4. 实际处理中的考量因素：

   • 在实际处理中，除了考虑保险赔偿外，还需综合考虑双方的经济状况、过错程度以及受伤情况等因素。若一方受伤严重且经济困难，另一方可能出于自愿多承担一部分医疗费。
   • 若双方无法就医疗费的分担达成一致，可以通过协商、调解或诉讼等途径解决争议。

举例说明： 假设机动车与非机动车发生事故，双方负同等责任。非机动车人员因此产生了20000元的医疗费。若机动车方投保了交强险，且交强险的医疗费用赔偿限额为18000元，则：

• 交强险将赔偿18000元；
• 超出部分为20000-18000=2000元；
• 双方各自承担2000/2=1000元。

总结与建议： 在机动车与非机动车发生事故且双方负同等责任的情况下，非机动车人员的医疗费将首先由交强险在赔偿限额内进行赔偿。超出部分则由双方按照各自的责任比例来分担。若遇争议或无法达成一致，建议及时咨询专业律师（即我本人，郭成律师，专注于合同纠纷、交通事故领域），通过合法途径解决争议。