您好，针对您从公司离职后注册证书的处理问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《注册建造师执业管理办法》(建市]〔2008〕48号)的相关规定，当您与原聘用企业解除劳动关系后，若需要注销注册证书，应当向相关部门提供与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料。这是注销注册证书的基本前提。

在您已经取得离职证明，并且公司已经停止为您缴纳医社保的情况下，理论上您已经具备了与原聘用企业解除劳动关系的有效证明。然而，如果公司仍然不予配合办理建造师相关手续，包括注销注册证书，您可以采取以下措施：

1. 准备申诉材料：

   • 编写一份详细的申请报告，其中应注明您的注册经历、与企业的纠纷情况，并在报告落款处亲笔签字并按手印，以证明报告的真实性。
   • 准备与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料，如离职证明、劳动合同解除协议等，并确保这些材料的原件和复印件都齐全。

2. 提交申诉：

   • 将上述准备好的申请报告和解除劳动关系的有效证明材料，提交到省注册中心注册科进行申诉。
   • 申诉时，请确保您提供的所有材料都是真实、准确、完整的，以便相关部门能够尽快处理您的申诉。

3. 关注申诉进展：

   • 在提交申诉后，您可以主动联系省注册中心注册科，了解申诉的进展情况。
   • 如果申诉过程中遇到任何问题或需要补充材料，请及时配合并提供所需信息。

4. 其他注意事项：

   • 如果您的注册证书涉及其他专业或行业，可能需要根据相关行业的规定进行注销或变更手续。
   • 在处理注册证书的过程中，请务必保持与原聘用企业的沟通，尽量通过协商解决问题，避免不必要的法律纠纷。

以福建省为例，省注册中心注册科的地址是福州市仓山区金山街道亭洲路6号省住建厅直属单位金山办公区综合楼二层221，联系电话是0591-38166-1（此电话仅为示例，实际电话请根据当地情况查询）。您可以根据自己所在地区的具体情况，查找并联系当地的省注册中心注册科进行申诉。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在处理注册证书的过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时联系我。