结论：公司暂扣工资是否合法，需根据具体情况判断，并非一概而论地合法或非法。
非法暂扣工资的情形
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若公司无法定理由擅自扣减员工工资，则构成违法行为。例如，公司因资金周转困难而擅自扣减员工工资，这种行为就是违法的。
应对措施：
- 员工可首先尝试与公司协商，要求公司补发被扣的工资。
- 若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，提交劳动合同、工资条等证据材料，劳动监察部门将依法进行调查，并对公司的违法行为进行处理。
- 员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
合法暂扣工资的情形
在以下特定情况下，公司暂扣工资是合法的：
代扣代缴费用：
- 个人所得税：公司作为扣缴义务人，有义务从员工工资中扣除个人所得税并上缴税务机关。
- 社会保险费用：公司及员工均需按比例缴纳社会保险费，公司可从员工工资中扣除员工个人应承担的部分。
- 法院判决、裁定中的费用：如抚养费、赡养费等，若法院判决由公司代扣，则公司可依法执行。
赔偿经济损失：
- 若员工因个人原因给公司造成经济损失，且双方劳动合同中有相关约定，公司可按约定从员工工资中扣除赔偿金。但需注意，每月扣除金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，员工因疏忽导致公司货物损坏，公司可依法从其工资中扣除赔偿金，但需遵守上述限制。
违反公司规定或合同条款：
- 在员工确实未完成工作任务、违反公司规章制度或劳动合同条款的情况下，若公司有相关制度规定或合同约定，且扣减工资的程序符合法律法规要求，那么公司暂扣工资的行为可能是合法的。但此情况需严格遵循法定程序，并确保扣减的合理性。
员工权益保护建议
面对公司暂扣工资的情况，员工应：
- 了解扣减的合法性：首先判断公司暂扣工资的行为是否合法，这直接关系到员工的应对策略和维权途径。
- 保留证据：保留所有与工资暂扣相关的证据，如工资单、银行转账记录、劳动合同、沟通记录等，以便在必要时提供证明。
- 与公司沟通协商：及时与公司沟通，了解扣减工资的具体原因，尝试达成和解，避免工资的无故扣除。
- 寻求法律援助：若认为公司行为不当，且协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，或依法申请劳动仲裁乃至提起诉讼，以维护自己的合法权益。
综上所述，公司暂扣工资是否合法需根据具体情况判断。员工应充分了解相关法律法规，以便在遭遇类似情况时能够做出正确的应对和决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。