针对企业改制的集体房产证双方共用情况下如何保证自己权益的问题，以下是一些具体的法律建议和操作步骤：

1. 明确产权归属与份额：

   • 首先，需要详细查阅并理解企业改制时的相关文件，特别是关于房产证归属和份额分配的条款。这些文件可能包括改制协议、资产评估报告、产权转让合同等。
   • 如果文件中有明确规定双方各自的产权份额，那么这就是保障权益的基础。务必确保这些文件是合法有效的，并且已经得到了相关部门的认可和登记。

2. 签订书面协议：

   • 即便在企业改制文件中已经明确了产权归属和份额，为了进一步保障自己的权益，建议与共用方签订一份详细的书面协议。
   • 协议中应明确双方的权利和义务，包括但不限于房产的使用、管理、维护、收益分配、转让条件等。
   • 协议应经过双方充分协商，并确保内容合法、明确、无歧义。必要时，可以请专业律师进行审查和修改。

3. 办理产权登记或变更登记：

   • 根据相关法律法规，房产的产权变更需要进行登记。因此，如果企业改制后房产证上的信息需要变更（如增加或减少共有人、变更份额等），应及时到相关部门办理产权登记或变更登记手续。
   • 登记是保障产权的重要手段，未经登记不得对抗善意第三人。因此，务必确保产权登记信息的准确性和完整性。

4. 保留相关证据：

   • 在日常使用和管理房产过程中，应保留好所有与房产相关的证据，如缴费凭证、维修记录、使用协议等。
   • 这些证据在发生纠纷时可以作为证明自己权益的重要依据。

5. 寻求法律救济：

   • 如果与共用方发生纠纷，且无法通过协商解决，可以寻求法律救济。
   • 可以向人民法院提起诉讼，要求确认自己的产权份额、要求共用方履行义务或赔偿损失等。
   • 在诉讼过程中，应提供充分的证据支持自己的主张，并遵循法院的判决和裁定。

6. 关注政策动态与法律法规变化：

   • 房产相关的政策动态和法律法规可能会发生变化，这些变化可能会影响到自己的权益。
   • 因此，建议定期关注相关政策动态和法律法规变化，及时调整自己的策略和措施以保障权益。

在具体操作过程中，还需要注意以下几点：

• 保持沟通：与共用方保持良好的沟通是解决问题的关键。通过沟通可以增进理解、减少误解和冲突。
• 尊重法律：在处理房产问题时，务必尊重法律、遵守法律。不要采取违法手段来维护自己的权益，否则可能会面临法律制裁。
• 寻求专业帮助：如果自己对房产法律问题不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和帮助，协助自己更好地维护权益。

最后，需要强调的是，每个具体案件的情况都是独特的，因此在处理企业改制的集体房产证双方共用问题时，应根据自己的实际情况和法律法规的规定来制定具体的策略和措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。