公司违法辞退肢体二级残疾员工，需按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金；若符合法定辞退情形，则需依法支付经济补偿及可能的一次性伤残就业补助金。具体分析如下：

一、违法辞退情形

1. 法律依据：根据《劳动合同法》第四十二条，在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的劳动者，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。若公司违反此规定辞退员工，则构成违法解除。

2. 赔偿标准：根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

二、合法辞退情形（需满足法定条件）

1. 法定辞退条件：根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

   • 在试用期间被证明不符合录用条件的；
   • 严重违反用人单位的规章制度的；
   • 严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
   • 劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
   • 因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
   • 被依法追究刑事责任的。

2. 经济补偿：若公司因上述法定情形辞退员工，且员工无过错，则需按照《劳动合同法》第四十七条的规定支付经济补偿。

3. 一次性伤残就业补助金：若员工因工致残被鉴定为二级伤残，根据《工伤保险条例》第三十五条，职工因工致残被鉴定为一级至四级伤残的，保留劳动关系，退出工作岗位，享受相应的工伤待遇。但若员工与公司解除或终止劳动关系（需符合法定条件，如员工主动提出或合同期满等），公司还需支付一次性伤残就业补助金。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。

三、特殊情形说明

• 工伤认定与赔偿：若员工因工致残被鉴定为二级伤残，其工伤待遇（包括一次性伤残补助金、伤残津贴等）由工伤保险基金支付。若公司未为员工缴纳工伤保险，则相关待遇由公司承担。
• 协商解除：若公司与员工协商一致解除劳动合同，公司需按照双方协商的结果支付经济补偿或赔偿金。

四、建议

• 收集证据：员工应收集与公司存在劳动关系的证据（如劳动合同、工资单、工作证等）以及公司辞退的证据（如辞退通知、录音录像等）。
• 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。不过，你可以直接向我咨询，我会为你提供详细的法律解答。
• 申请劳动仲裁：若与公司协商无果，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。