针对借款人下落不明且金额很大的情况，建议采取以下立案方式及法律程序：
向法院申请宣告借款人失踪（如符合条件）
若借款人下落不明满2年（或因意外事件下落不明满2年且经有关机关证明不可能生存），可依据《民法典》第40条向其住所地基层法院申请宣告失踪。法院宣告后，可指定财产代管人，通过代管人追偿债务。此程序为后续诉讼或执行提供法律基础，但需注意：宣告失踪不直接解决债务问题，需结合其他程序主张权利。
直接向法院提起民事诉讼
- 管辖法院：根据《民事诉讼法》第23条，可向被告住所地或合同履行地法院起诉。若借款人户籍地与经常居住地不一致，需提供其经常居住地证据（如居住证明、物业记录等）。
- 送达方式：若借款人下落不明，法院会通过公告送达（通常为60日），公告期满后视为送达。此时借款人未出庭，法院可缺席判决。
- 证据要求：需提供借款合同、转账记录、催款记录等证明借贷关系及金额的证据。若金额巨大，建议同步提交借款人财产线索（如房产、车辆、银行账户等），为后续执行做准备。
申请财产保全（诉前或诉中）
- 诉前保全：若情况紧急（如借款人正在转移财产），可在起诉前向法院申请冻结其银行账户、查封房产等。需提供担保（如保险公司保函、现金等），且需在30日内提起诉讼。
- 诉中保全：立案后申请法院采取保全措施，需提交初步证据证明债务存在及借款人财产状况。
申请支付令（如符合条件）
若借款关系明确（如有书面借条、转账记录等），且无其他债务纠纷，可依据《民事诉讼法》第221条向法院申请支付令。法院受理后15日内向借款人发出支付令，若其在15日内未提出异议且不履行，可申请强制执行。但若借款人下落不明，支付令可能因无法送达而失效，需结合诉讼程序。
执行阶段措施
- 列入失信被执行人名单：判决生效后，若借款人未履行，可申请法院将其纳入失信名单，限制高消费、乘坐飞机高铁等。
- 悬赏执行：向法院申请发布悬赏公告，征集借款人财产线索，对提供有效线索者给予奖励。
- 刑事报案（如涉嫌犯罪）：若借款人以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相骗取借款，可能构成诈骗罪。可向公安机关报案，但需注意：民事借贷与刑事诈骗的界限需严格区分，需提供充分证据证明借款人主观恶意。
风险提示与建议：
- 借款人下落不明可能导致诉讼周期延长（如公告送达、执行困难），建议同步通过律师调查令、委托第三方调查机构等方式挖掘其财产线索。
- 若金额巨大，建议委托律师介入，制定综合诉讼策略（如同时申请宣告失踪、诉讼、保全等），提高追偿效率。
- 保留所有书面证据原件，避免因证据缺失导致败诉风险。
如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。