针对员工迟到早退、擅自离岗的处理方式，需结合公司规章制度、劳动合同及法律规定综合判断，具体处理步骤及注意事项如下：

1. 依据公司规章制度处理

• 前提条件：公司需有明确、合法且已公示的规章制度（如《员工手册》），规定迟到早退、擅自离岗的处罚措施（如扣工资、警告、解除合同等）。
• 处理方式：
  • 首次或轻微违规：可给予口头或书面警告，并要求员工签署确认，留存证据。
  • 多次或严重违规：根据公司制度，可采取扣减绩效工资、降职降薪等措施。若制度明确规定“累计旷工X天可解除合同”，且员工行为符合条件，可依法解除劳动合同。
• 注意事项：制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则可能被认定为无效，导致公司处罚违法。

2. 依据劳动合同处理

• 前提条件：劳动合同中明确约定了工作时间、考勤制度及违约责任（如“迟到早退超X次，公司有权解除合同”）。
• 处理方式：若员工行为违反合同约定，公司可依据合同条款处理，但需确保条款不违反法律强制性规定（如最低工资、解除合同程序等）。
• 注意事项：合同条款需具体、明确，避免模糊表述（如“严重违反公司规定”需结合制度具体化）。

3. 依据法律规定处理

• 合法解除合同的情形：
  • 根据《劳动合同法》第39条，员工“严重违反用人单位的规章制度”或“严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害”的，公司可解除合同且无需支付补偿。
  • 关键点：需证明员工行为“严重”且造成实际损害（如擅自离岗导致客户流失、生产事故等），否则可能被认定为违法解除。
• 违法解除的后果：若公司无法证明员工行为符合法定解除条件，需支付赔偿金（2N，N为工作年限）。
• 工资扣减限制：根据《工资支付暂行规定》，公司仅可扣减迟到早退对应时间的工资（如迟到1小时扣1小时工资），且扣减后不得低于当地最低工资标准。

4. 处理流程建议

• 步骤1：固定证据（如考勤记录、监控录像、员工签字确认的违规记录）。
• 步骤2：依据制度或合同给予书面警告，并要求员工签收。
• 步骤3：若员工拒不改正，可依据制度或合同升级处罚（如降薪、解除合同）。
• 步骤4：解除合同前，需通知工会（如有）并听取意见，确保程序合法。

5. 风险提示

• 程序违法风险：未履行民主程序、未公示制度或未通知工会，可能导致解除合同违法。
• 证据不足风险：仅凭口头陈述或单一证据（如同事证言）可能被法院驳回。
• 赔偿风险：违法解除需支付赔偿金，且可能影响公司声誉。

总结：公司可依据合法有效的制度、合同或法律规定处理迟到早退、擅自离岗行为，但需确保程序合法、证据充分。若涉及解除合同，建议提前咨询专业律师，避免法律风险。如有具体案例或细节需要分析，可直接向我提问。