在交通事故中，若双方负同等责任，道路交通救助基金垫付的费用原则上由交通事故的责任方按责任比例偿还，即肇事车主和受害者均需根据责任比例承担相应的偿还责任。 以下是对此问题的详细分析：
一、偿还责任的法律依据与主体
法律依据：
- 根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十四条和《中华人民共和国道路交通安全法》第七十五条的规定，道路交通事故社会救助基金（以下简称救助基金）在特定情形下会先行垫付受害人的丧葬费用、部分或全部抢救费用。这些特定情形包括抢救费用超过交强险责任限额、肇事机动车未参加交强险、机动车肇事后逃逸等。
- 救助基金管理机构在垫付费用后，有权向道路交通事故责任人追偿。
偿还责任主体：
- 在交通事故中，无论事故是单方责任还是双方责任，最终都由造成交通事故的责任方按责任比例承担偿还责任。在同等责任的情况下，肇事车主和受害者均需根据责任比例承担相应的偿还责任。
二、同等责任下的偿还责任划分
责任比例：
- 在同等责任的情况下，肇事车主和受害者各自承担50%的责任。因此，对于救助基金垫付的费用，双方也应按照50%的比例进行偿还。
偿还方式：
- 如果肇事车主和受害者均有能力偿还，那么双方应各自承担50%的偿还责任。
- 如果一方暂时无力偿还，但后续有赔偿能力时，仍需履行偿还义务。救助基金管理机构有权在其有赔偿能力后进行追偿。
三、特殊情况的处理
责任人不明或逃逸：
- 如果交通事故中存在责任人不明或逃逸且无法追偿的情况，救助基金垫付的费用可能无需偿还。但这种情况并不适用于同等责任的情形，因为同等责任意味着双方责任明确。
保险理赔：
- 如果肇事车主的车辆投保了交强险或商业三者险，在保险责任范围内，可通过保险理赔来偿还救助基金。例如，交强险在限额内赔付救助基金，不足部分再由商业三者险赔付。但需要注意的是，保险理赔并不免除肇事车主的偿还责任，而是作为一种偿还方式。
四、申请与偿还流程
申请流程：
- 申请道路交通救助基金时，需由公安机关交通管理部门在3个工作日内书面通知救助基金管理机构，并提交相关材料。救助基金管理机构会对申请材料进行严格审核，确保申请的合理性和真实性。
偿还流程：
- 责任人应按照救助基金管理机构的要求进行偿还。如果责任人拒不偿还，救助基金管理机构有权依法向其进行追偿，包括通过协商、诉讼等合法途径来实现。
五、实际案例说明
假设在一起交通事故中，肇事车主和受害者负同等责任。救助基金为受害者垫付了10万元的抢救费用。那么，根据责任比例，肇事车主和受害者各自应承担5万元的偿还责任。如果肇事车主的车辆投保了交强险和商业三者险，且保险责任范围内足够覆盖5万元的偿还责任，那么可以先由保险进行赔付。如果保险赔付不足或肇事车主未投保相关保险，则肇事车主需自行承担剩余的偿还责任。
总结来说，在交通事故中若双方负同等责任，道路交通救助基金垫付的费用原则上由双方按责任比例偿还。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。