缺失行政强制措施凭证时，应当根据具体情况采取不同的处理方式，核心原则是确保程序合法性并维护自身权益。以下是具体分析和建议：

1. 立即核实缺失原因
   首先需确认凭证缺失的具体环节：是行政机关未出具、遗失，还是未送达当事人？若行政机关未依法出具凭证，可能涉嫌程序违法；若凭证在传递过程中遗失，需区分责任主体（如行政机关内部管理问题或当事人保管不当）。

2. 分情况处理

   • 行政机关未出具凭证：
     根据《行政强制法》第十八条、第二十四条，行政机关实施强制措施时应当当场交付决定书和清单。若未出具，当事人有权要求行政机关立即补正，并可录音录像留存证据。若行政机关拒绝补正，可向上级机关或同级政府投诉，或直接提起行政复议/诉讼主张程序违法。
     
   • 凭证遗失但行政行为已实施：
     若强制措施已执行（如查封、扣押财物），当事人可要求行政机关出具书面说明或补办凭证。若行政机关拒绝，需通过复议/诉讼确认行政行为违法，并主张返还财物、赔偿损失等权利。
     
   • 凭证遗失且影响权益：
     若因凭证缺失导致无法证明财物被扣押、无法主张权利（如超期扣押未通知），可直接以“程序违法”为由申请复议或起诉，要求撤销行政行为或确认无效。

3. 关键证据固定

   • 保留与行政机关沟通的记录（如录音、短信、邮件）；
     
   • 收集现场目击者证言或监控录像；
     
   • 若财物被扣押，可要求行政机关出具接收证明或拍摄扣押现场照片。

4. 法律救济途径

   • 行政复议：自知道行政行为之日起60日内向复议机关申请，主张程序违法并要求撤销或补正；
     
   • 行政诉讼：直接向法院起诉，若行政机关无法提供合法凭证，法院将认定行政行为违法；
     
   • 国家赔偿：若因凭证缺失导致财物损坏、灭失，可依据《国家赔偿法》主张赔偿。

提示：行政强制措施凭证是证明行政行为合法性的核心文件，缺失可能直接导致行政行为被撤销。建议根据具体情况选择上述途径，并优先通过书面形式与行政机关沟通，保留所有证据。如有复杂情况，可进一步向我描述细节，我会结合具体案情提供针对性建议。