结论：在此情况下，即使您已经与快递员达成协议并赔偿了40元，丢件人（业主）仍然有权选择报警。报警是业主的权利，但具体法律后果需根据实际情况判断。以下从多个角度为您详细分析：

1. 业主报警的权利：

   • 业主作为丢件人，其财产权益受到侵害，有权向公安机关报案，要求调查并处理此事。报警是业主维护自身权益的一种合法途径，不受您与快递员之间协议的影响。

2. 您与快递员之间的协议：

   • 您与快递员之间达成的赔偿协议，是双方之间的民事行为，对双方具有约束力。然而，该协议并不直接涉及业主的权益，除非业主明确表示同意或追认该协议。
   • 如果业主未参与该协议，且对该协议内容不知情或不同意，那么该协议对业主不产生法律效力。业主仍有权就其丢失的快递件向相关责任方（可能是您、快递员或快递公司）主张权利。

3. 可能的法律后果：

   • 民事责任：如果业主选择通过民事途径解决纠纷，如起诉您或快递员要求赔偿，法院将根据双方提供的证据和法律规定，判断责任归属和赔偿金额。
   • 刑事责任：虽然您已经赔偿了40元，但如果业主认为您的行为构成盗窃或其他犯罪行为，并坚持要求公安机关立案侦查，那么公安机关将依法进行调查。如果调查结果显示您的行为确实构成犯罪，您将面临刑事责任的追究。不过，在您已经赔偿且情节轻微的情况下，刑事责任的可能性相对较小。

4. 建议：

   • 与业主沟通：建议您主动与业主沟通，解释事情经过和您已经与快递员达成赔偿协议的情况，争取业主的理解和谅解。
   • 保留证据：保留好您与快递员之间的赔偿协议、转账记录等证据，以备不时之需。
   • 配合调查：如果业主选择报警，您应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。

进一步思考：在此类纠纷中，各方应尽可能通过协商和调解的方式解决争议，以减少不必要的法律纠纷和成本。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。同时，也提醒您在日常生活中要尊重他人的财产权益，避免类似纠纷的发生。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。