核心结论：公交司机撞伤人且保险公司赔付款用完，让伤者自己垫付药费的情况，伤者可通过以下途径解决：
- 与公交公司协商
- 协商依据：公交司机是在执行工作任务过程中造成他人损害的，根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条规定，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。所以公交公司作为用人单位，有义务对伤者进行赔偿。
- 协商内容：伤者可以与公交公司沟通，说明目前保险公司赔付款已用完，但自己仍需要继续治疗，要求公交公司先行垫付药费。在协商时，伤者要保留好相关的医疗费用票据、诊断证明等证据，以证明自己确实产生了这些费用以及费用的合理性。
- 协商结果：如果公交公司同意垫付，双方可以签订书面的协议，明确垫付的金额、支付方式、后续的赔偿处理等事项。如果公交公司拒绝垫付，伤者可以采取其他法律途径解决。
- 向公交公司主张赔偿
- 起诉条件：如果与公交公司协商无果，伤者可以向法院提起诉讼，要求公交公司承担赔偿责任。起诉时需要准备充分的证据，包括事故认定书、医疗费用票据、诊断证明、病历、与公交公司协商的记录等。
- 赔偿范围：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释的规定，公交公司应赔偿伤者的医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。
- 诉讼流程：伤者需要向有管辖权的法院提交起诉状和相关证据，法院受理后会安排开庭审理。在审理过程中，双方可以进行举证、质证和辩论。法院会根据查明的事实和法律规定作出判决。如果公交公司不履行判决，伤者可以申请法院强制执行。
- 申请道路交通事故社会救助基金（如有适用情况）
- 申请条件：在一些地区设有道路交通事故社会救助基金，当交通事故中受害人的抢救费用超过交强险责任限额、肇事机动车未参加交强险或者机动车肇事后逃逸等情况下，可以申请该基金垫付部分或全部抢救费用。如果伤者的情况符合申请条件，可以向相关部门提出申请。
- 申请流程：伤者或其家属需要向当地的道路交通事故社会救助基金管理机构提交申请，并提供相关的证明材料，如事故认定书、医疗费用票据、诊断证明等。基金管理机构会对申请进行审核，审核通过后会垫付相应的费用。后续，基金管理机构有权向交通事故责任人追偿。