违法所得没收程序中，父母的合法财产以及配偶的合法财产，通常是不会被执行的。以下是对这一问题的详细分析：
违法所得没收程序的基本原则
违法所得没收程序是刑事诉讼中的一项特别程序，旨在追缴犯罪嫌疑人、被告人违法所得的一切财物及其孳息。这一程序的核心在于“违法所得”，即与犯罪行为直接相关的财物。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释的规定，违法所得没收程序应当严格遵循法定原则，确保只对违法所得进行没收，而不涉及犯罪嫌疑人、被告人的其他合法财产。
合法财产的保护
父母合法财产：父母的财产属于其个人合法财产，与犯罪嫌疑人、被告人的违法所得无直接关联。在违法所得没收程序中，父母的财产不受影响，不会被执行没收。
配偶合法财产：同样，配偶的财产也属于其个人合法财产。除非能够证明配偶的财产中包含了犯罪嫌疑人、被告人的违法所得，或者配偶与犯罪嫌疑人、被告人共同实施了犯罪行为并获取了违法所得，否则配偶的财产也不会被执行没收。在大多数情况下，配偶的合法财产是受到法律保护的。
特殊情况下的考虑
尽管父母的合法财产和配偶的合法财产通常不会被执行没收，但在某些特殊情况下，也可能存在例外。例如：
如果犯罪嫌疑人、被告人将违法所得转移至父母或配偶名下，以逃避法律制裁，且能够证明这一点，那么这部分财产可能会被视为违法所得的延伸，从而面临被没收的风险。
如果父母或配偶与犯罪嫌疑人、被告人共同实施了犯罪行为，并共同获取了违法所得，那么他们共同拥有的财产中属于违法所得的部分，也可能会被没收。
法律建议
保留证据：对于父母和配偶来说，保留好自己财产的合法来源证据至关重要。这可以在必要时证明自己的财产与犯罪嫌疑人、被告人的违法所得无关。
及时咨询：如果面临违法所得没收程序，或者担心自己的财产可能受到影响，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见，帮助保护合法财产权益。
配合调查：在违法所得没收程序中，配合相关部门的调查是必要的。但配合调查并不意味着要放弃自己的合法权益。在配合调查的同时，也要积极维护自己的合法财产权益。
总结来说，违法所得没收程序主要针对的是犯罪嫌疑人、被告人的违法所得，而父母的合法财产以及配偶的合法财产通常是不会被执行的。但在特殊情况下，也可能存在例外。因此，保留好自己财产的合法来源证据，并在必要时及时咨询专业律师，是保护自己合法权益的重要措施。如果你有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。