结论：签合同名称甲方是公司，但盖的是分公司的章子，这样的合同在法律上是否有效，需分情况讨论。一般来说，若分公司具有独立营业执照和相应民事行为能力，合同有效；若分公司无独立资质或超出授权范围，则合同效力可能受影响。
详细分析：
分公司具有独立营业执照和相应民事行为能力的情况：
- 根据《公司法》及相关法律法规，分公司虽然不具有法人资格，但如果其依法设立并领取了营业执照，那么它就在总公司的授权范围内，以自己的名义从事民事活动，并承担相应的民事责任。
- 在这种情况下，如果分公司签订的合同在其经营范围和总公司授权范围内，且合同内容合法、双方意思表示真实，那么该合同是有效的。即使合同上甲方写的是总公司名称，但盖的是分公司的章子，只要分公司有相应的民事行为能力，合同仍然具有法律效力。
分公司无独立营业执照或超出授权范围的情况：
- 如果分公司没有独立的营业执照，或者虽然领取了营业执照但超出了总公司的授权范围签订合同，那么该合同的效力可能会受到影响。
- 在这种情况下，合同可能被视为无效或者效力待定。如果总公司事后追认该合同，那么合同可能变为有效；如果总公司拒绝追认，那么合同可能被视为无效，由此造成的损失可能由分公司或相关责任人承担。
合同名称与盖章不一致的法律后果：
- 合同名称上写的是总公司，但盖章的是分公司，这种不一致可能会引发合同主体认定上的争议。在诉讼或仲裁中，法院或仲裁机构可能会根据合同的实际履行情况、双方当事人的真实意思表示以及相关法律法规的规定，来综合判断合同的主体和效力。
- 为了避免这种争议，建议在签订合同时，确保合同名称与盖章主体一致，或者明确在合同中注明分公司是代表总公司签订合同，并明确双方的权利和义务。
建议：
- 在签订合同时，务必确保合同名称与盖章主体一致，或者明确在合同中注明相关情况，以避免后续的法律纠纷。
- 如果分公司需要代表总公司签订合同，建议事先获得总公司的明确授权，并在合同中注明授权范围和期限。
- 如果对合同的效力存在疑问，或者遇到合同纠纷，建议及时咨询专业律师，以便得到专业的法律意见和帮助。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答。