油气管道第三方施工审批备案中双方签字盖章的法律依据主要涉及以下方面：

1. 《中华人民共和国石油天然气管道保护法》
   该法第三十五条明确规定，进行可能危及管道安全的施工作业时，施工单位应当与管道企业共同制定管道保护方案，并签订安全防护协议。签字盖章是协议生效的法定形式要件，体现双方对协议内容的确认与法律责任的承担。此外，第三十七条进一步要求施工单位将协议报管道所在地县级人民政府主管管道保护工作的部门备案，备案材料中需包含经双方签章的协议文本。

2. 《中华人民共和国民法典》合同编
   根据第四百九十条，当事人采用书面形式订立合同的，自双方签字、盖章或者按指印时合同成立。安全防护协议作为典型书面合同，需通过签字盖章完成合同成立要件，确保双方权利义务的明确性与可追溯性。若协议涉及重大利益或风险分配，签字盖章的严谨性直接关系到合同效力及纠纷解决时的证据效力。

3. 行政备案的实质性要求
   备案虽为行政监督程序，但《石油天然气管道保护法》及地方实施细则（如《山东省石油天然气管道保护条例》）均要求备案材料包含“经双方确认的施工方案及安全防护协议”。签字盖章的协议是行政机关审查施工合法性的核心依据，未履行该程序可能导致施工被叫停或行政处罚。例如，某省住建厅曾因施工单位未提交签章协议而撤销其施工许可。

4. 安全责任分配的法定化
   签字盖章行为不仅是形式要求，更具有实质法律意义。根据《安全生产法》第四十八条，两个以上生产经营单位在同一作业区域内作业可能危及对方安全的，应当签订安全生产管理协议。签字盖章的协议是划分施工方与管道企业安全责任的关键证据，在事故责任认定中具有优先效力。例如，某法院在判决中明确，未签章的协议因形式瑕疵导致安全责任无法明确，双方需按过错比例分担损失。

实务建议：

• 管道企业应要求施工单位在协议中明确施工范围、期限、安全措施及违约责任，并留存签章原件；
  
• 施工单位需在备案前核对协议内容与施工方案一致性，避免因内容冲突导致备案无效；
  
• 双方可约定协议签章后生效，并明确备案完成时间节点，以规避行政程序瑕疵风险。
  

如需进一步分析具体协议条款或地方性法规适用，可直接向我咨询。