妨害药品管理罪在特定情形下是可以不予起诉的，这些情形主要包括法定不起诉、酌定不起诉以及存疑不起诉三大类，以下是对这些情形的详细阐述：
法定不起诉情形（绝对不起诉）：
- 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：若妨害药品管理的行为虽形式上符合构成要件，但实际危害后果极其轻微，对药品管理秩序和公众健康损害可忽略不计，则根据刑法的谦抑性原则，不作为犯罪处理。例如，药店药品摆放不规范但未影响药品质量和公众健康，并及时整改的情况，可能构成此情形。
- 犯罪已过追诉时效期限的：妨害药品管理罪经过一定期限后不再追诉。法定最高刑不满五年有期徒刑的，经过五年；五年以上不满十年的，经过十年。若行为发生在十年前，且对应法定最高刑为三年，十年后被发现时已过追诉时效，则不予起诉。
- 经特赦令免除刑罚的：特赦是由国家元首或最高权力机关免除特定犯罪人全部或部分刑罚的制度。若妨害药品管理罪行为后经特赦免除刑罚，则不予起诉。
- 犯罪嫌疑人、被告人死亡的：犯罪嫌疑人或被告人死亡后，刑事诉讼程序无法继续，因刑事责任承担主体不存在，检察机关应作出不予起诉决定。
酌定不起诉情形（相对不起诉）：
- 犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的：若妨害药品管理行为情节较轻，如初次实施、未造成严重后果、积极配合调查、有悔罪表现等，且根据刑法规定不需判处刑罚或可免除刑罚，检察机关可作出酌定不起诉决定。例如，药品生产企业存在轻微违规行为但产品质量合格且及时整改的情况，可能构成此情形。
- 犯罪嫌疑人有自首或立功表现的：若犯罪嫌疑人在案发后主动投案自首，或检举、揭发他人重大犯罪行为，有立功表现，检察机关在综合考虑案情和悔罪态度后，可能作出不起诉决定。
存疑不起诉情形（证据不足不起诉）：
- 证据不足，不符合起诉条件的：若妨害药品管理案中，现有证据无法达到确实、充分的证明标准，不能排除合理怀疑地证明犯罪嫌疑人实施了妨害行为，检察机关应作出存疑不起诉决定。例如，关键证人证言矛盾且无其他有力证据印证的情况，可能构成此情形。
其他依法不应当追究刑事责任的情形：
- 包括犯罪嫌疑人不满十六周岁、是精神病人等依法不负刑事责任的情况，检察机关都会依法作出不起诉决定。
法律建议：
- 若您或您身边的人涉嫌妨害药品管理罪，且认为符合上述不予起诉的情形，建议及时咨询专业律师，以便更准确地评估案件情况，并采取相应的法律措施。
- 同时，无论案件是否会被起诉，都应积极配合调查，如实陈述事实，提供相关证据，以维护自身合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条、第一百七十七条、第一百七十五条等相关规定，为妨害药品管理罪不予起诉的情形提供了明确的法律依据。
综上所述，妨害药品管理罪的不予起诉情形需结合《刑事诉讼法》及相关法律规定，并根据案件具体情况进行综合判断。每个案件都有其独特性和复杂性，检察机关在决定是否起诉时，会严格依据法律规定和证据情况进行综合考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。