结论：离婚后房子归女方，男方不配合过户的，女方起诉要求男方配合过户存在诉讼时效限制，但需根据具体情况判断是否适用以及具体时效期间。

分析说明：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
   • 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

2. 离婚后房产过户的诉讼时效适用：

   • 在离婚协议中约定房产归女方所有，但男方不配合过户的情况下，女方可以依据离婚协议向法院提起诉讼，要求男方履行过户义务。
   • 这种情况下，诉讼时效的起算点通常是从女方知道或应当知道男方不配合过户之日起计算，即女方权利受到损害之日。
   • 如果离婚协议中明确约定了过户时间，而男方未按时履行，则诉讼时效可能从约定过户时间届满之日起计算。

3. 特殊情况下的诉讼时效：

   • 如果女方在离婚后一直不知道男方不配合过户，或者虽然知道但因某种原因无法行使权利（如被男方欺骗、威胁等），则可能构成诉讼时效中止或中断的情形。
   • 诉讼时效中止是指在诉讼时效期间的最后六个月内，因法定事由不能行使请求权的，诉讼时效中止。从中止时效的原因消除之日起，诉讼时效期间继续计算。
   • 诉讼时效中断是指因法定事由致使已经进行的诉讼时效期间全部归于无效，待中断时效的事由消除后，诉讼时效期间重新计算。

4. 实际操作建议：

   • 女方在发现男方不配合过户后，应尽快收集相关证据（如离婚协议、房产证、沟通记录等），并向法院提起诉讼。
   • 如果担心诉讼时效问题，可以在提起诉讼前咨询专业律师，评估诉讼时效是否已经届满或是否存在中止、中断的情形。
   • 在诉讼过程中，女方应积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以维护自己的合法权益。

后续行动建议：

• 女方应尽快与男方沟通，尝试通过协商解决过户问题。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
• 在提起诉讼前，女方应确保自己掌握了充分的证据，以支持自己的诉讼请求。
• 如果对诉讼时效或其他法律问题存在疑问，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。