在对方停下来跨三车道掉头，被直行车辆撞上的情况下，责任归属需根据具体情况及交通法规来判断，不能一概而论地说直行车辆是否要负责任。以下是从不同角度进行的分析：
一、基本责任原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第九十一条，公安机关交通管理部门应根据交通事故当事人的行为对发生交通事故所起的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任。这意味着，在判断责任时，需要综合考虑双方的行为和过错程度。
二、具体责任划分
掉头车辆的责任：
- 如果掉头车辆在掉头过程中未遵守交通规则，如未开启转向灯、未观察路况、突然掉头等，导致直行车辆无法及时避让而发生碰撞，那么掉头车辆通常要承担主要或全部责任。
- 跨三车道掉头本身就是一个较为危险的行为，如果掉头车辆未确保安全，那么其过错程度可能较大。
直行车辆的责任：
- 如果直行车辆在行驶过程中未保持安全车速、未注意观察路况、未采取必要的避让措施等，导致与掉头车辆发生碰撞，那么直行车辆也可能要承担一定责任。
- 特别是在掉头车辆已经明显开始掉头动作，且直行车辆有足够时间和距离进行避让的情况下，如果直行车辆未采取避让措施，那么其过错程度可能较大。
三、特殊情形考虑
- 路况和视线：如果事故发生时的路况复杂，如视线受阻、路面湿滑等，或者掉头车辆和直行车辆都存在视线盲区，那么这些因素也可能对责任划分产生影响。
- 交通信号和标志：如果事故发生地点有交通信号灯或交通标志指示，那么双方是否遵守这些指示也是判断责任的重要因素。
四、责任判断流程
- 确定事故责任：首先，需要由公安机关交通管理部门根据现场勘查、调查和相关检验鉴定，及时制作事故认定书，确定事故责任方。
- 查看保险情况：接着，查看双方是否有保险，包括交强险和商业险。如果有保险，先向保险公司申请赔偿。
- 保险赔偿与侵权人赔偿：根据保险情况和事故责任，由保险公司或侵权人承担相应的赔偿责任。如果保险赔偿不足或没有保险，则由侵权人承担剩余的赔偿责任。
五、法律建议
- 保留证据：在事故发生后，双方应尽可能保留现场照片、视频、证人证言等证据，以便后续处理。
- 及时报警：无论事故责任如何，双方都应及时报警，由公安机关交通管理部门进行处理。
- 协商或诉讼：根据事故责任认定，双方可以协商赔偿或通过调解、诉讼解决纠纷。
总结来说，在对方停下来跨三车道掉头被直行车辆撞上的情况下，责任归属需根据具体情况及交通法规来判断。如果掉头车辆未遵守交通规则或未确保安全，那么其通常要承担主要或全部责任；如果直行车辆也存在过错，那么其也可能要承担一定责任。因此，在处理此类事故时，应综合考虑双方的行为和过错程度，以及路况、视线、交通信号和标志等因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。