行政单位私设科室是否违法，需分情况讨论：

1. 若私设科室未经法定程序审批或备案：

   • 违法性：根据《地方各级人民政府机构设置和编制管理条例》等相关法律法规，行政单位的机构设置需遵循严格的法定程序，包括审批、备案等环节。若行政单位未经法定程序私自设立科室，这通常被视为违法行为。
   • 法律后果：私设科室可能导致行政单位面临行政处罚，如警告、罚款、撤销私设科室等。同时，私设科室的行为也可能影响行政单位的公信力和形象，甚至可能引发公众对行政单位合法性的质疑。

2. 若私设科室虽未经审批，但符合行政单位内部管理需要且未造成不良影响：

   • 违法性存疑：虽然未经审批设立科室在形式上可能违反了相关法律法规，但如果该科室的设立确实符合行政单位内部管理需要，且未对外部产生不良影响，那么其违法性可能相对较弱。然而，这并不意味着私设科室的行为就是合法的，因为任何行政单位的机构设置都需遵循法定程序。
   • 建议：即使私设科室出于内部管理需要，行政单位也应尽快补办相关审批手续，以确保其合法性。同时，行政单位应加强内部管理，避免类似情况再次发生。

3. 若私设科室涉及超越职权或滥用职权：

   • 违法性明确：如果私设科室的行为涉及超越行政单位的法定职权或滥用职权，那么这种行为无疑是违法的。例如，私设科室擅自开展本应由其他部门或上级部门负责的工作，或者利用私设科室进行权力寻租、谋取私利等。
   • 法律后果：超越职权或滥用职权的行为可能导致行政单位及其相关责任人员面临更严重的法律后果，包括行政处分、刑事责任等。同时，这种行为也可能严重损害行政单位的形象和公信力。

法律建议：

• 加强合规意识：行政单位应加强对相关法律法规的学习和理解，确保机构设置符合法定程序和要求。
• 完善内部管理：行政单位应建立健全内部管理制度，明确机构设置的审批流程和责任分工，避免私设科室等违规行为的发生。
• 及时整改：如果发现存在私设科室的情况，行政单位应及时进行整改，补办相关审批手续或撤销私设科室，以消除违法状态。

总结：行政单位私设科室是否违法需根据具体情况判断。无论如何，行政单位都应严格遵守相关法律法规和内部管理制度，确保机构设置的合法性和合规性。如果您对行政单位私设科室的问题有进一步的疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。