结论：在内部车辆转让协议签订后，因车辆有故障卖方不想卖了是否能退，需根据协议的具体条款、双方协商情况以及法律规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、协议条款的约定
若协议中有明确约定：
- 如果转让协议中明确规定了车辆交付时的质量标准，以及卖方在车辆存在质量问题时的责任和义务（如退车、维修、赔偿等），那么卖方应当按照协议约定履行。若车辆故障符合协议中约定的退车条件，卖方应当退车。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。若卖方不履行协议约定的义务，买方有权要求卖方承担违约责任，包括退车、赔偿损失等。
若协议中无明确约定：
- 如果转让协议中没有明确约定车辆的质量标准或卖方在车辆存在质量问题时的责任和义务，那么双方需要依据法律规定和交易习惯来协商解决。
二、双方协商情况
双方协商一致：
- 无论协议中是否有明确约定，如果双方能够就退车事宜达成一致意见，那么卖方可以退车，并可能需要根据协商结果承担一定的赔偿责任或买方放弃部分权益。
双方协商不一致：
- 如果双方无法就退车事宜达成一致意见，那么买方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
三、法律规定
车辆质量瑕疵担保责任：
- 根据《民法典》的相关规定，出卖人交付的标的物应当符合约定的质量要求。若出卖人交付的标的物存在质量瑕疵，买受人有权要求出卖人承担修理、重作、更换、退货、减少价款或者报酬等违约责任。
- 应用：在车辆买卖纠纷中，如果车辆存在故障且该故障影响车辆的正常使用或价值，买方可以要求卖方承担退车等违约责任。
合同解除权：
- 在特定情况下，买方或卖方可能享有合同解除权。例如，如果卖方故意隐瞒车辆的重要瑕疵或买方因卖方的违约行为而无法实现合同目的，买方或卖方可能有权解除合同并要求退车。
- 应用：若车辆故障严重到足以影响买方购买车辆的目的，且卖方在签订协议时未如实告知，买方可能有权解除合同并要求退车。
四、建议与行动
审查协议条款：
- 首先，双方应仔细审查转让协议中的相关条款，特别是关于车辆质量、卖方责任和义务以及违约责任等方面的约定。
协商解决：
- 其次，双方应尝试通过友好协商的方式解决纠纷。在协商过程中，双方可以就退车、赔偿等事宜进行充分沟通，并寻求达成一致意见。
法律途径：
- 如果协商无果，买方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，买方可以向法院提起诉讼或申请仲裁，要求卖方承担退车、赔偿损失等违约责任。
进一步思考：在处理此类纠纷时，除了考虑法律因素外，双方还应考虑商业信誉、长期合作关系等因素。有时候，通过妥协和协商达成一个双方都能接受的解决方案可能比通过法律途径解决更为有利。因此，在处理车辆买卖纠纷时，双方应保持冷静和理性，寻求最佳解决方案。若您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。