结论：车辆托底后申请非事故救援再修车，保险公司不一定会拒保，需分情况讨论。以下是具体分析：

1. 非事故救援的性质与保险条款的关联
   非事故救援通常指因车辆故障（如电瓶没电、轮胎漏气、燃油耗尽等）导致的道路救援服务，与交通事故导致的损坏无关。若保险条款中明确约定“仅承保事故导致的损失”，则非事故救援本身不会触发拒保，但后续修车费用是否理赔需看具体原因：

   • 若修车是因托底导致底盘损坏（如油底壳破裂、悬挂受损），且托底属于保险责任范围（如碰撞、倾覆等），则保险公司应理赔；
     
   • 若托底未造成实际损坏，或损坏属于免责条款（如自然磨损、老化），则保险公司可能拒赔修车费用，但不会因申请过非事故救援而拒保。

2. 保险公司拒保的常见理由与应对
   保险公司拒保通常需基于合同条款或法定事由，常见情形包括：

   • 未如实告知风险：若投保时隐瞒车辆实际状况（如已存在故障），保险公司可能以“未如实告知”为由拒保；
     
   • 故意或重大过失：若托底是因驾驶人故意行为或严重违反操作规程导致，保险公司可能拒赔；
     
   • 免责条款触发：若保险合同明确约定“非事故导致的损失不赔”，且修车原因符合免责情形，保险公司可拒赔。
     建议：申请理赔时，保留托底现场照片、救援记录、维修清单等证据，证明损失与托底事故的因果关系，避免保险公司以“非事故损失”为由拒赔。

3. 非事故救援服务与保险理赔的独立性
   非事故救援服务（如拖车、搭电）通常是保险公司提供的增值服务，与车损险的理赔范围独立。即使申请了非事故救援，只要修车原因属于保险责任（如托底导致的事故性损坏），保险公司仍需理赔。
   例外：若非事故救援服务本身导致车辆损坏（如拖车时操作不当造成二次损伤），需根据救援服务合同或侵权责任主张赔偿，与车损险无关。

总结：车辆托底后申请非事故救援，不会直接导致保险公司拒保，但修车费用能否理赔需结合托底原因、保险条款及证据情况综合判断。若遇到拒保争议，可依据《保险法》第22条（提供理赔所需证明材料）及第23条（保险公司及时核定并赔付）主张权利，必要时通过诉讼解决。如有具体条款或案例细节，可进一步向我咨询。