立案后撤案是否会留案底，主要取决于案件的性质、撤案的具体原因以及相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：

一、刑事案件

1. 不会留案底的情况

   • 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：例如，轻微盗窃案件中，盗窃金额小且未造成实质性危害，经调查不构成犯罪，撤案后不会留下案底。
   • 犯罪已过追诉时效期限的：如最高刑不满5年有期徒刑的犯罪，经过5年后，司法机关不再追诉，撤案不留案底。
   • 经特赦令免除刑罚的：国家元首或最高权力机关命令免除刑罚的特定犯罪人，撤案后不会留下案底。
   • 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的：如侮辱罪、诽谤罪等，被害人撤回控告后，撤案不会留下案底。
   • 犯罪嫌疑人、被告人死亡的：刑事诉讼程序无法继续，案件撤销，不会留下案底。

2. 可能留下相关记录的情况

   • 检察机关决定不起诉，但犯罪行为确实存在：虽然案件终止，但犯罪事实存在，可能会留下记录。这种记录主要用于公安机关内部管理和统计，不对外公开，对日常生活影响有限。例如，在某些经济犯罪案件中，检察机关可能因证据不足或情节轻微而决定不起诉，但相关调查记录可能仍会保留在公安机关。

二、民事案件

• 民事案件立案后又撤案，是当事人自行处分诉讼权利的行为，意味着诉讼程序终止，不存在“案底”。例如，合同纠纷中，原告与被告和解后撤案，不会对当事人留下不良记录。

三、行政案件

• 若违法行为轻微并及时改正，未造成危害后果，行政机关决定不予行政处罚而撤案的，一般不留案底。
• 若违法行为已认定并作出行政处罚决定，后续因某种原因撤销处罚决定的，相关记录仍可能存在，但这种记录不属于犯罪记录，对日常生活影响较小。例如，违反治安管理处罚法的行为，如果违法行为轻微且当事人及时纠正，没有造成危害后果，公安机关可以撤案，不会留下案底。

注意事项与建议

1. 证据不足导致的撤案：如果撤案是因为证据不足等原因，后续如果发现新的证据，可能会重新立案侦查。但这并不改变之前撤案时不留案底的事实。
2. 公安机关的事件记录：虽然撤案不会留下案底，但在公安机关处可能会有相应的事件记录。这种记录通常不会对个人产生实质性的影响，因为它并不等同于犯罪记录。
3. 关注民事责任：即使案件被撤销，如果涉及到财务纠纷或者人身伤害等民事责任，当事人仍然需要通过民事诉讼等途径寻求法律救济。

总结来说，立案后撤案是否会留案底，需根据案件性质、撤案原因及法律法规综合判断。对于刑事案件中的特定情形，撤案后通常不会留案底；民事案件和行政案件撤案后一般不会留下案底。如有任何疑虑或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供准确的法律解答和建议。