民事起诉立案再撤案，通常不会留下案底。以下是对这一问题的详细分析：

一、案底的定义与性质

案底，一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度。在我国法律中，案底通常指有过刑事犯罪前科的档案记录，存放在公安部门与相关国家机关。它是对个人犯罪行为的一种官方记录，具有严肃性和永久性，会对个人的职业选择、社会评价等方面产生深远影响。

二、民事起诉立案再撤案的法律后果

1. 撤诉的含义：撤诉是指在人民法院受理案件之后，宣告判决之前，原告要求撤回其起诉的行为。

2. 撤诉的法律效果：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。准予撤诉的，诉讼程序即告终结，原告不得以同一事实和理由再行起诉（除非有新的事实或证据）。

3. 撤诉对案底的影响：由于撤诉并未导致法院作出有罪判决，因此不会形成案底。撤诉只是诉讼程序的一种终结方式，并不涉及对个人犯罪行为的认定和记录。

三、不同情况下的分析

1. 民事案件撤诉：

   • 在民事案件中，撤诉是原告的一项权利。只要符合法律规定的条件，原告可以随时申请撤诉。
   • 撤诉后，案件即告终结，不会对原告产生任何案底记录。例如，若甲因乙欠其款项而起诉，后双方达成和解，甲申请撤诉，此时甲不会留下案底。

2. 刑事案件中的类似情况（虽非直接相关，但为全面分析提供参考）：

   • 在刑事案件中，如果检察院撤回起诉并获得法院裁定准许，同样不会产生案底。因为撤诉意味着案件未进入审判阶段，更未作出有罪判决。
   • 但需注意，若刑事案件在侦查阶段或审查起诉阶段因特定原因（如证据不足、情节显著轻微等）而撤案，也通常不会留下案底。然而，如果案件已构成犯罪但因特定原因（如情节轻微）而撤案，或检察院作出酌定不起诉决定，则可能会留下相关记录，尽管这种记录不同于严格意义上的“案底”。

四、需要注意的事项

1. 证据不足导致的撤案：

   • 如果撤案是因为证据不足等原因，后续如果发现新的证据，可能会重新立案侦查。但这并不改变之前撤案时不留案底的事实。

2. 公安机关的事件记录：

   • 虽然撤案不会留下案底，但在公安机关处可能会有相应的事件记录。这种记录通常不会对个人产生实质性的影响，因为它并不等同于犯罪记录。

3. 有罪判决与撤案的区别：

   • 需要强调的是，如果案件经过侦查、起诉、审判等程序，最终法院作出了有罪判决，那么当事人就会有案底。这与撤案是完全不同的法律后果。

综上所述，民事起诉立案再撤案，通常不会留下案底。这是因为撤诉并未导致法院作出有罪判决，因此不会形成对个人犯罪行为的官方记录。然而，具体情况还需根据案件的实际进展和最终处理结果来确定。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。