在车祸中，如果车主被认定为次要责任方，而伤者被认定为主要责任方，并且伤者进行了伤残鉴定，那么车主的保险公司是否会给伤者赔付，这确实是一个涉及多方面因素的问题。以下是我为您详细梳理的解答：

一、交强险的赔偿

首先，无论责任比例如何划分，根据我国《道路交通安全法》的规定，机动车发生交通事故造成人身伤亡的，保险公司在机动车第三者责任强制保险（即交强险）的责任限额范围内都会予以赔偿。交强险的赔偿是不区分责任比例的，它主要包括：

1. 医疗费用赔偿：限额为1.8万元，这涵盖了伤者的医药费、诊疗费、住院费等医疗相关费用。

2. 伤残赔偿：限额为18万元，这包括残疾赔偿金、护理费、康复费等因伤残而产生的费用。

3. 财产损失赔偿：限额为2000元，用于赔偿车辆及其他财产的损失。

二、商业险及对方（车主）的赔偿

如果伤者的损失超出了交强险的赔偿限额，那么就需要考虑商业险的赔偿了。如果车主投保了商业第三者责任险，那么超出交强险部分，车主应承担的赔偿份额会由商业险按照合同约定进行赔偿。此时，责任比例的划分（如您提到的车主次责、伤者主责）就会影响到具体的赔偿金额。车主只需承担其责任比例内的赔偿责任，这部分赔偿会由商业险来承担。

三、伤者自身保险的赔偿

如果伤者自己购买了车上人员责任险或人身意外伤害险等保险，那么根据保险合同的约定，伤者也可能从自己的保险公司获得一定的赔偿。

四、特殊情况与操作建议

1. 特殊情况：如果事故是与非机动车或行人发生的，那么赔偿的处理可能会与机动车间的事故有所不同。在这种情况下，即使机动车一方承担主要责任，赔偿时也可能根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任。

2. 操作建议：

   • 及时咨询专业律师：由于涉及的法律知识点较多，建议您在处理此类事故赔偿时及时咨询专业律师，以维护自身的合法权益。
   • 保留相关证据：包括医疗记录、伤残鉴定报告、事故责任认定书等，这些证据在后续赔偿时将起到至关重要的作用。
   • 了解保险条款：详细阅读自己与对方的保险合同条款，明确赔偿范围和条件，以便在赔偿过程中做到心中有数。

综上所述，即使在车祸中车主被认定为次要责任方，而伤者被认定为主要责任方，并且伤者进行了伤残鉴定，车主的保险公司仍然有可能在交强险和商业险的范围内给伤者进行赔付。但具体的赔偿情况需要根据双方的保险情况、责任比例划分以及当地的法律规定来确定。因此，建议您在处理此类事故时保持冷静，及时咨询专业人士以获取最准确的法律意见和赔偿方案。