二次商务签一般不可以由所在公司代签。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、签证申请的基本原则

签证申请是个人行为，通常要求申请人本人亲自提交申请材料并接受面试（如需要）。这是因为签证官需要评估申请人的个人情况、旅行目的、经济能力等多方面因素，以确保申请人符合签证要求。因此，从签证申请的基本原则来看，二次商务签不应由公司代签。

二、公司代签的潜在问题

1. 法律责任问题：如果公司代签签证，一旦出现问题（如签证被拒、申请人非法滞留等），公司可能面临法律责任。因为公司并非签证申请人，其代签行为可能被视为伪造或篡改申请材料，从而触犯法律。

2. 签证真实性：签证官在审核申请时，会关注申请材料的真实性和一致性。如果公司代签，可能导致申请材料与实际情况不符，从而影响签证的审批结果。

3. 申请人权益：申请人本人对签证申请过程应有充分的了解和参与。如果公司代签，申请人可能无法及时了解申请进度和结果，也无法在需要时提供额外的材料或信息。

三、特殊情况下的考虑

虽然一般情况下二次商务签不应由公司代签，但在某些特殊情况下，如申请人因特殊原因无法亲自提交申请（如疾病、残疾等），且能够提供充分的证明材料时，可能可以考虑由公司或第三方机构协助提交申请。然而，这种情况需要得到签证机构的明确许可，并遵循相关的规定和程序。

四、法律建议

1. 遵守签证申请规定：申请人应亲自提交签证申请，并确保申请材料的真实性和一致性。

2. 咨询专业机构：如果申请人对签证申请流程有疑问或需要协助，可以咨询专业的签证服务机构或律师事务所，以获取准确的指导和帮助。

3. 保护个人权益：申请人应了解自己的权益和责任，在签证申请过程中保持警惕，避免被不法分子利用或欺骗。

如有任何关于签证申请或公司法务方面的疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。