结论：一般情况下，不能直接将男方告到其公司，但可以通过法律途径要求男方承担相应责任，具体分析如下：
一、关于能否直接告到男方公司
从法律角度来看，个人之间的纠纷，尤其是涉及亲子关系确认和抚养费支付的问题，通常不直接涉及公司作为被告。公司是一个独立的法人实体，其责任与个人责任是分开的。除非男方作为公司员工，其行为严重违反了公司规章制度或法律法规，且该行为与公司有直接关联（这种情况极为罕见且复杂），否则一般不能直接将男方告到其公司。
二、关于如何通过法律途径要求男方承担责任
亲子关系确认：
- 如果男方不承认与孩子的亲子关系，女方可以通过法律途径申请亲子鉴定，以确认男方是否为孩子的生物学父亲。
- 亲子鉴定是确认亲子关系最直接、最有效的方法，其结果具有法律效力。
抚养费支付：
- 一旦确认男方为孩子的生物学父亲，女方可以要求男方支付抚养费。
- 抚养费的具体数额和支付方式，可以根据双方的实际情况和孩子的需要，通过协商或诉讼来确定。
- 如果男方拒绝支付抚养费，女方可以向法院提起诉讼，要求法院判决男方支付抚养费，并可以申请强制执行。
三、关于法律程序和注意事项
收集证据：
- 在提起诉讼前，女方需要收集相关证据，如孩子的出生证明、亲子鉴定报告（如果已进行）、与男方的沟通记录等，以证明男方与孩子的亲子关系以及男方拒绝承担责任的事实。
咨询律师：
- 由于法律程序可能复杂且耗时，女方在提起诉讼前最好咨询专业律师，了解具体的法律程序和注意事项，以及可能面临的法律风险和后果。
保持冷静和理性：
- 在处理此类纠纷时，女方需要保持冷静和理性，避免情绪化行为影响案件的进展和结果。
四、关于可能的法律后果
- 如果法院最终判决男方为孩子的生物学父亲，并要求其支付抚养费，男方必须履行判决义务。否则，女方可以申请强制执行，法院有权采取一系列措施来强制男方履行义务。
- 如果男方拒绝配合亲子鉴定或拒绝承认判决结果，法院可以根据相关证据和法律规定作出相应判决，并可能对男方采取罚款、拘留等强制措施。
建议：女方在处理此类纠纷时，应首先通过法律途径确认亲子关系，并要求男方承担相应责任。如有需要，可以随时向我咨询具体的法律程序和注意事项。