结论：在厂区卫生间吸烟被拍照是否违法需分情况讨论，若拍摄行为侵犯隐私权或肖像权则可能违法；若未侵犯相关权益则一般不违法。针对被拍照情况，可通过协商、投诉或诉讼等方式处理。以下是具体分析：
一、拍摄行为是否违法
- 若拍摄行为侵犯隐私权
- 法律规定：根据《民法典》第一千零三十二条规定，自然人享有隐私权。任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。隐私是自然人的私人生活安宁和不愿为他人知晓的私密空间、私密活动、私密信息。
- 分析：厂区卫生间属于相对私密的空间，在卫生间内吸烟属于个人私密活动。如果拍摄者未经允许，擅自拍摄他人在卫生间吸烟的照片，并将照片进行传播等行为，就可能侵犯了被拍摄者的隐私权，属于违法行为。
- 若拍摄行为侵犯肖像权
- 法律规定：依据《民法典》第一千零一十九条，任何组织或者个人不得以丑化、污损，或者利用信息技术手段伪造等方式侵害他人的肖像权。未经肖像权人同意，不得制作、使用、公开肖像权人的肖像，但是法律另有规定的除外。
- 分析：如果拍摄者将拍摄的照片用于商业目的、恶意丑化被拍摄者或者未经同意公开传播等，就可能侵犯了被拍摄者的肖像权，构成违法。
- 若拍摄行为未侵犯隐私权和肖像权
- 分析：如果拍摄者只是在自己手机等设备中保存照片，没有进行传播、公开等行为，且拍摄目的并非恶意，一般不构成侵犯隐私权和肖像权，不违法。例如，厂区为了加强安全管理，在卫生间安装监控（需提前告知且符合相关规定），拍摄到员工吸烟情况，这种拍摄行为通常不违法。
二、被拍照后的处理方式
- 与拍摄者协商
- 操作方式：如果发现被拍照，可以先尝试与拍摄者进行沟通，要求其删除照片，并承诺不再传播。在协商过程中，要保持冷静和理性，说明自己的诉求和理由。
- 示例：可以礼貌地对拍摄者说：“您好，我知道您拍了我吸烟的照片，这涉及到我的隐私，希望您能把照片删除，并且不要传播出去，谢谢。”
- 向厂区管理部门投诉
- 操作方式：如果协商无果，或者拍摄者是厂区内部人员且其行为违反了厂区规定，可以向厂区的管理部门（如人力资源部门、安全保卫部门等）进行投诉。提供相关证据（如看到拍摄者的特征、拍摄时间地点等），要求厂区管理部门介入处理。
- 示例：向厂区安全保卫部门提交书面投诉信，详细描述被拍照的经过，附上可能的证据线索，请求他们调查并责令拍摄者删除照片。
- 通过法律途径解决
- 操作方式：如果拍摄者的行为严重侵犯了自己的隐私权或肖像权，给自己造成了较大的损害（如名誉受损、精神伤害等），可以通过向法院提起诉讼的方式来维护自己的合法权益。在起诉前，要收集好相关证据，如照片、证人证言等。
- 示例：委托律师起草民事起诉状，向有管辖权的法院提交，要求拍摄者停止侵害、消除影响、赔礼道歉，并赔偿相应的损失。