农民工工资多发，应当及时与用人单位沟通并退回多发的部分。以下是具体分析和操作建议：
法律义务角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条的规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。因此，农民工在收到多发工资后，有法律义务将多余部分退还给用人单位。
操作步骤：
- 及时沟通：一旦发现工资多发，应立即与用人单位的财务部门或人力资源部门取得联系，说明情况，并表达退回多发工资的意愿。
- 确认金额：与用人单位确认多发的具体金额，确保双方对退款金额无异议。
- 选择退款方式：根据用人单位的要求，选择合适的退款方式，如通过银行转账、现金退回等。如果选择银行转账，应确保转账信息准确无误，并保留好转账凭证。
- 保留证据：在退回多发工资的过程中，应保留好与用人单位的沟通记录、转账凭证等相关证据，以备不时之需。
注意事项：
- 诚信原则：农民工应秉持诚信原则，及时退回多发工资，避免给用人单位造成不必要的损失。
- 避免纠纷：在退回多发工资的过程中，应与用人单位保持良好沟通，避免因退款问题产生不必要的纠纷。
- 法律保护：如果用人单位在要求退回多发工资的过程中存在违法行为（如威胁、恐吓等），农民工有权依法维护自己的合法权益。