结论：打入农民工专用账户的工资因收款人银行卡限额遭退回，一般情况下不会被挪用，但具体还需根据实际情况和相关规定来判断。以下从多个角度进行分析：
专用账户的性质与目的：
- 农民工专用账户是专门为农民工工资支付而设立的，其目的在于确保农民工工资能够按时、足额支付，避免工资被挪用或拖欠。
- 专用账户的资金通常受到严格的监管，包括开户银行、建设单位、施工总承包单位等多方的共同监督，以确保资金的安全和合规使用。
银行卡限额退回的情况：
- 当工资因收款人银行卡限额而遭退回时，这通常意味着工资未能成功转入农民工的个人账户。
- 在这种情况下，工资款项应会保留在专用账户中，或者根据相关规定和流程进行退回处理，而不是被挪用。
挪用工资的法律后果：
- 如果有人试图挪用专用账户中的工资款项，这将构成违法行为，可能面临法律制裁，包括罚款、刑事责任等。
- 农民工有权向相关部门投诉或举报挪用工资的行为，以维护自己的合法权益。
实际操作中的建议：
- 对于农民工而言，如果发现工资因银行卡限额而遭退回，应及时与用人单位或银行联系，了解具体情况并寻求解决方案。
- 用人单位应确保农民工工资的支付流程顺畅，避免因银行卡限额等问题导致工资支付受阻。
- 如果怀疑工资被挪用，农民工应立即向当地劳动监察部门或公安机关报案，以便及时调查和处理。
额外提醒：虽然一般情况下工资不会被挪用，但农民工仍应保持警惕，定期查询自己的工资账户，确保工资按时、足额到账。如果遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。