关于您提出的“在师自动离职能否算教龄”的问题，这实际上涉及到工龄的计算以及养老保险权益的认定，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，教龄通常与工龄紧密相关，在大多数情况下，教龄可以被视为工龄的一部分。然而，当涉及到自动离职的情况时，工龄的计算就会受到一定影响。

根据人力资源社会保障部对相关问题的答复以及我国职工基本养老保险制度的规定，职工在建立养老保险制度前的连续工龄，在符合国家规定的情况下，可以视同缴费年限。但关键在于，如果职工被除名或自动离职，其原工作单位将不再负责支付退休费，且重新参加工作后，连续工龄会重新计算。这意味着，自动离职前的工作年限通常不能作为连续工龄的组成部分，也不能视同缴费年限。

对于特岗教师而言，虽然您在基层服务了两年，但如果未满服务期就自动离职，且没有结岗证书，那么这两年通常不能直接认定为工龄。这是因为工龄的认定需要依据一定的规定和程序，而自动离职往往打断了这一连续过程。

不过，您也不必过于担心。如果您后来重新参加了工作，并且按照规定缴纳了养老保险费，那么您的实际缴费年限是可以被记录和保障的。此外，根据国家有关政策规定，如果您达到退休年龄时累计缴费年限不足15年，您还有几种选择：一是可以延长缴费至满15年；二是如果社会保险法实施前参保、延长缴费五年后仍不足15年的，可以一次性缴费至满15年；三是您可以申请转入户籍所在地城乡居民基本养老保险，享受相应的养老保险待遇。

至于您提到的在一般工厂上班有合同有社保有离职证明就可以认定工龄的情况，这确实是一种常见的工龄认定方式。但对于特岗教师等特殊职业群体，工龄的认定可能需要更加严格的证明材料和程序。如果您希望认定在特岗教师岗位的工龄，建议您咨询当地教育部门或人力资源社会保障部门，了解具体的认定条件和所需材料。

总的来说，自动离职通常会影响工龄的计算和养老保险权益的认定。但您仍然可以通过后续的工作和缴费来积累实际缴费年限，并享受相应的养老保险待遇。希望这些解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或疑虑，欢迎随时向我提问。