结论：未经本人允许直接办理法人变更或设立的行为，通常属于违法行为，具体取决于行为的具体内容和相关法律法规的适用。以下从不同角度进行详细分析：
一、法人设立与变更的法定程序
法人设立：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，设立公司（法人）需要满足一系列法定条件，包括但不限于股东人数、注册资本、公司章程等，并且需要经过工商行政管理部门的登记注册。
- 在设立过程中，必须明确公司的法定代表人，该法定代表人通常由公司章程规定，并需经过合法程序选举或任命。未经本人允许，擅自将其列为法定代表人，显然违反了法定程序。
法人变更：
- 法人变更，包括法定代表人变更，也需要遵循法定程序。通常，这涉及到公司内部决策机构的决议（如股东会或董事会决议），以及向工商行政管理部门提交变更登记申请。
- 未经本人允许，擅自办理法人变更，特别是将他人变更为法定代表人，同样违反了法定程序，可能构成违法行为。
二、未经允许办理法人的法律后果
民事责任：
- 如果未经本人允许，擅自将其列为法定代表人或办理法人变更，导致该人遭受经济损失（如因公司债务被追偿、因公司违法行为被处罚等），该人有权要求侵权人承担民事赔偿责任。
行政责任：
- 工商行政管理部门在发现未经允许办理法人变更或设立的行为时，有权对违法行为人进行行政处罚，包括但不限于罚款、撤销变更登记等。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果未经允许办理法人的行为涉及伪造、变造国家机关公文、证件、印章等犯罪行为，还可能构成刑事犯罪，依法追究刑事责任。
三、特殊情况下的考量
- 表见代理与善意取得：虽然这些概念通常用于民事法律关系中，但在某些极端情况下，如果第三方有合理理由相信行为人有权代表公司办理法人变更或设立，并且该第三方是善意的（即不知情且无过错），那么公司可能需要对第三方的合理信赖承担一定责任。然而，这并不改变未经允许办理法人行为的违法性。
- 内部程序瑕疵与外部效力：即使公司内部存在某些程序瑕疵（如未召开股东会或董事会决议），但如果该瑕疵并未影响外部第三方的合理信赖，且工商行政管理部门已经办理了变更登记，那么从外部效力上看，该变更可能仍然有效。但这并不意味着未经允许办理法人的行为是合法的，公司内部仍需承担相应责任。
四、建议与措施
- 对于被擅自列为法定代表人的人：应尽快向工商行政管理部门提出异议，并要求撤销相关变更登记。同时，可以考虑通过法律途径追究侵权人的民事责任。
- 对于公司：应加强内部管理，确保法人变更或设立等重大事项遵循法定程序。如果发现未经允许办理法人的行为，应立即采取措施纠正，并追究相关责任人的责任。
总结：未经本人允许直接办理法人变更或设立的行为，通常属于违法行为，可能涉及民事责任、行政责任甚至刑事责任。因此，建议各方在办理相关事务时严格遵循法定程序，确保合法合规。如果您或您所在的公司遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。