在合同纠纷中，关于跑单费用的承担问题，并没有一个固定的答案，而是需要根据具体的合同条款、双方约定以及实际情况来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
合同有明确约定：
- 如果合同中明确规定了跑单费用的承担方式，比如由哪一方承担、承担的比例等，那么双方应当按照合同约定来执行。这种情况下，合同条款就是解决纠纷的直接依据。
合同无明确约定，但双方有口头协议或行业惯例：
- 如果合同中没有明确约定跑单费用的承担，但双方在交易过程中有口头协议，或者该行业有普遍接受的惯例，那么这些口头协议或行业惯例也可以作为判断的依据。不过，口头协议在举证上可能存在一定的困难，需要双方提供充分的证据来支持自己的主张。
- 例如，在某些物流行业中，可能存在“跑单费由发货方承担”的惯例，如果双方都知晓并同意这一惯例，那么在发生纠纷时，就可以按照这一惯例来处理。
合同无明确约定，也无口头协议或行业惯例：
- 如果合同中没有明确约定跑单费用的承担，双方也没有口头协议，且该行业没有普遍接受的惯例，那么就需要根据实际情况和公平原则来判断。
- 在这种情况下，法院或仲裁机构可能会考虑双方的实际损失、过错程度、交易习惯等因素，来综合判断跑单费用应该由哪一方承担，或者双方各自承担多少。
特殊情况下的处理：
- 如果跑单是由于一方的违约行为导致的，比如发货方未按时提供货物、收货方未按时接收货物等，那么违约方可能需要承担因此产生的跑单费用。
- 另外，如果跑单是由于不可抗力因素导致的，比如自然灾害、政府行为等，那么双方可能需要根据实际情况协商分担跑单费用，或者根据合同中的不可抗力条款来处理。
建议：
- 在签订合同时，双方应当尽可能明确约定跑单费用的承担方式，以避免后续发生纠纷。
- 如果合同中没有明确约定，双方可以在交易过程中通过书面形式补充约定，或者保留好相关证据以支持自己的主张。
- 在发生纠纷时，双方应当首先尝试通过协商来解决，如果协商不成，可以寻求法律途径来维护自己的权益。
如果你在处理合同纠纷时遇到了跑单费用承担的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。