不建议与资质过期的公司签订协议。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律风险角度
合同效力问题：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方应当具备相应的民事行为能力。若公司资质过期，可能意味着其不再具备从事特定业务或活动的法定条件，这可能影响其民事行为能力的有效性。
- 在此情况下，与资质过期的公司签订的协议可能因对方主体资格瑕疵而面临被认定为无效或可撤销的风险。
违约责任风险：
- 资质过期的公司可能因无法履行合同义务而构成违约。若合同中未明确约定违约责任或约定不明确，受损方可能难以获得充分的法律救济。
- 此外，即使合同中约定了违约责任，若对方公司因资质问题而无力承担，受损方也可能面临执行难的问题。
二、商业风险角度
业务稳定性：
- 资质过期的公司可能面临监管部门的处罚或停业整顿，这将直接影响其业务的稳定性和连续性。
- 与此类公司签订协议，可能因对方业务中断而给自身带来不必要的损失和风险。
信誉风险：
- 资质过期的公司可能因违规行为而损害其商业信誉。与信誉不佳的公司合作，可能对自身的商业形象和声誉造成负面影响。
三、建议与措施
尽职调查：
- 在与任何公司签订协议前，都应进行充分的尽职调查，包括核实对方的资质、信誉、业务稳定性等方面。
- 对于资质过期的公司，应特别关注其是否正在办理资质续期手续以及续期的可能性。
合同条款设计：
- 若因特殊原因必须与资质过期的公司签订协议，应在合同中明确约定对方的资质续期义务以及违约责任。
- 同时，可以考虑设置保证金、违约金等条款以增加对方的违约成本，降低自身风险。
法律咨询：
- 在签订协议前，建议咨询专业律师以获取法律意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和风险防范措施。
总结：与资质过期的公司签订协议存在较大的法律风险和商业风险。为了保障自身权益和降低风险，建议避免与此类公司签订协议。若因特殊原因必须签订，应进行充分的尽职调查并设计合理的合同条款以防范风险。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。