在建筑工程施工中，建设单位与施工单位签订阴阳合同，主要违反了《中华人民共和国招标投标法》及其相关实施条例的规定，同时也可能触犯《民法典》合同效力规则及《刑法》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一、违反《招标投标法》的规定
串通投标或弄虚作假：
- 在必须进行招标的项目中，如果建设单位与施工单位签订阴阳合同，以规避招标或虚假招标的方式确定中标人，这构成串通投标或弄虚作假，直接违反了《招标投标法》的相关规定。
- 处罚依据：根据《招标投标法》第五十三条，此类行为可导致中标无效，并处以中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，也可处以单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。若存在违法所得，还将并处没收违法所得。情节严重的，甚至可能取消其一至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格，并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。若给他人造成损失，还需依法承担赔偿责任。
背离合同实质性内容：
- 即使项目非必须招标，但如果双方签订的合同与招标文件、中标人的投标文件在实质性内容上不一致，如工程范围、建设工期、工程质量、工程价款等核心条款存在差异，这也违反了《招标投标法实施条例》的相关规定。
- 处罚依据：根据《招标投标法实施条例》第七十五条，此类行为可由有关行政监督部门责令改正，并处以中标项目金额5‰以上10‰以下的罚款。
二、违反《民法典》合同效力规则
阳合同无效：
- 阳合同，即用于备案或对外公示的合同，如果其内容并非双方的真实意思表示，而是为了应付监管或获取其他不正当利益而签订的，那么该合同可能因虚假意思表示而无效。
阴合同违法情形：
- 阴合同，即实际履行的合同，如果其内容存在违法情形，如恶意串通损害国家、集体或第三人利益，或者违反法律、行政法规的强制性规定，那么该合同也可能无效。
- 法律后果：根据《民法典》的相关规定，合同无效后，因该合同取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
三、涉嫌刑事犯罪
逃税罪：
- 如果阴阳合同的签订是为了逃避税收，且少缴税款数额较大（达到一定标准），那么相关责任人员可能触犯逃税罪。
- 法律后果：根据《刑法》的相关规定，逃税罪可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，可处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
行贿罪等：
- 如果阴阳合同的签订过程中存在行贿等违法行为，以谋取不正当利益，那么相关责任人员还可能触犯行贿罪等其他刑事犯罪。
- 法律后果：根据《刑法》的相关规定，行贿罪可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；因行贿谋取不正当利益，情节严重的，或者使国家利益遭受重大损失的，可处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节特别严重的，或者使国家利益遭受特别重大损失的，可处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
四、合规建议与风险防范
严格履行备案合同：确保实际执行的内容与备案合同一致，避免签订阴阳合同。
合理调整价款：如需变更合同内容，应通过合法程序（如签订补充协议）并重新备案，确保合同的合法性和有效性。
加强内部管控：建立合同审查机制，对合同条款进行严格审查，避免签署存在违法情形的阴阳合同。
及时咨询专业律师：在复杂项目中，提前进行法律风险评估，确保合同签订和履行的合法性和合规性。
总结来看，签订阴阳合同不仅可能面临行政处罚（如罚款、降级、吊销资质等），还可能引发民事纠纷和刑事责任。因此，建设单位和施工单位应严格遵守法律法规，通过合法途径解决合同履行中的问题，避免因小失大。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。