在起诉后协商时，为保障自身权益，可考虑增加以下条款，具体需结合案件实际情况和诉求来定：
- 赔偿条款
- 明确赔偿范围：详细列出因对方违约或侵权行为所造成的直接损失和间接损失，如医疗费、误工费、财产损失、精神损害赔偿等，并约定具体的计算方式。
- 赔偿支付方式：约定赔偿款的支付时间、支付方式（如一次性支付或分期支付）以及逾期支付的违约责任，如加收滞纳金或利息等。
- 履行条款
- 具体履行内容：如果协商涉及对方继续履行合同或采取补救措施，应明确履行的具体内容、标准、时间节点等。
- 履行监督：可以约定由第三方机构或双方共同认可的人对履行情况进行监督，确保对方按约定履行。
- 违约责任条款
- 加重违约责任：鉴于已经起诉，可以在协商中加重对方的违约责任，如提高违约金比例、约定更高的赔偿标准等，以增加对方违约的成本。
- 违约处理方式：明确对方违约时的处理方式，如解除合同、要求继续履行、赔偿损失等，并约定具体的操作流程。
- 保密条款
- 保密内容：约定双方在协商过程中及协商后所知悉的对方商业秘密、个人隐私等信息应予以保密。
- 保密期限：明确保密信息的保密期限，以及违反保密义务应承担的责任。
- 争议解决条款
- 解决方式：虽然已经起诉，但协商中仍可以约定争议解决的方式，如继续通过诉讼解决或选择仲裁等。
- 管辖法院/仲裁机构：如果选择诉讼解决，可以约定管辖法院；如果选择仲裁，应明确仲裁机构。
- 其他条款
- 合同变更与解除：约定在何种情况下可以变更或解除协商达成的协议，以及变更或解除的程序和条件。
- 通知与送达：明确双方通知与送达的方式、地址和联系方式，确保双方能够及时收到对方的通知和文件。
举例说明：
假设你因对方未按时支付货款而起诉，在协商时，你可以要求增加以下条款：
- 对方应在协商达成后的XX日内支付全部货款及逾期利息；
- 如对方未按约定支付，应支付违约金XX元，并承担你因追讨货款而产生的律师费、诉讼费等费用；
- 双方应对协商内容及在协商过程中知悉的对方商业秘密予以保密，保密期限为XX年；
- 如发生争议，应提交XX仲裁委员会进行仲裁。
在协商过程中，务必确保所有条款都明确、具体、可执行，并尽量以书面形式记录下来，以避免后续产生争议。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。