在诉讼中，若两个被告中有一个不适格，法院会根据不同的程序阶段和具体情况作出相应的处理和判决。以下是对此问题的详细分析：
一、立案阶段
法院处理方式：
- 在立案审查阶段，若法院发现其中一个被告明显不适格，即该被告并非与案件有直接利害关系的责任主体，法院可能会建议原告更换适格的被告。
- 若原告同意更换，则诉讼继续进行；若原告坚持不更换，法院可能裁定不予受理该案件，以确保诉讼的针对性和有效性。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条的规定，起诉必须符合有明确的被告等条件，且被告应当是与案件有直接利害关系的责任主体。若被告不适格，则可能被视为不符合起诉条件。
二、审理阶段
原告主动变更被告：
- 若在审理过程中发现其中一个被告不适格，原告有权主动申请变更适格的被告。
- 变更需符合法律规定和程序要求，如提供新被告的明确信息、证明新被告与案件的利害关系等。
- 法院在审查后，通常会准许原告变更被告，并继续对案件进行审理，最终根据查明的事实和法律规定作出判决。
原告拒绝变更被告：
- 若法院向原告释明被告不适格，并建议其变更被告，但原告坚持拒绝变更，则法院可能会判决驳回原告对该不适格被告的诉讼请求。
- 这是因为以不适格的被告进行诉讼不符合诉讼主体的要求，无法使诉讼围绕真正的责任主体展开，继续审理将失去实际意义。
法院依职权处理：
- 在某些明显情况下，如被告明显不适格且原告拒绝变更，法院可依职权裁定驳回原告对不适格被告的起诉，以避免不必要的诉累。
继续审理与其他被告：
- 若案件中还有其他适格被告，且这些被告与案件有实质性法律关系，诉讼可继续进行，不适格被告将不再纳入审理范围。法院将仅对适格被告的部分继续审理并作出判决。
三、原告应对策略
仔细审查被告资格：
- 在提起诉讼前，原告应仔细审查被告的资格，确保其为与案件有直接利害关系的责任主体，以避免因被告不适格而导致诉讼被驳回或产生不必要的诉累。
及时变更被告：
- 若在诉讼过程中发现被告不适格，原告应及时向法院申请变更适格的被告，以确保诉讼的顺利进行和自身权益的有效维护。
了解法律程序：
- 原告应了解相关的法律程序和规定，以便在诉讼过程中能够正确应对各种情况，如法院的建议、裁定等。
四、实际案例参考
假设在一个合同纠纷案件中，原告将A公司和B公司列为共同被告，但在审理过程中发现B公司并非合同当事人，与案件无直接利害关系，即B公司不适格。此时，法院可能会建议原告撤回对B公司的起诉或变更适格的被告。若原告坚持不撤回或不变更，法院可能会判决驳回原告对B公司的诉讼请求，并继续对A公司进行审理并作出判决。
综上所述，当两个被告中有一个不适格时，法院会根据具体情况作出相应的处理和判决。原告应充分了解相关法律程序和规定，并在诉讼过程中积极配合法院的工作，以确保诉讼的顺利进行和自身权益的有效维护。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。