摩托车因交通事故被扣留后，需通过合法程序取回，核心步骤如下：

1. 确认扣车依据与期限
   根据《道路交通安全法》第72条，交警因收集证据需要可扣留事故车辆，但需出具《行政强制措施凭证》，并告知扣留期限（一般不超过30日，经批准可延长至60日）。若交警未依法出具凭证或超期扣留，可向其上级部门申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 配合事故责任认定程序

   • 交警会在扣留后10日内出具《道路交通事故责任认定书》，明确双方责任比例。
     
   • 若对认定结果有异议，需在收到认定书后3日内申请复核，否则视为认可。
     
   • 关键点：责任认定是取车前提，需主动跟进进度，避免因程序延误导致扣车时间延长。

3. 履行赔偿义务或达成和解

   • 若您负全责或部分责任，需按认定结果赔偿对方车辆损失（可通过保险公司理赔或自行支付）。
     
   • 若与对方达成和解协议（如一次性赔偿并签署《和解书》），可要求对方出具《放车同意书》，加快取车流程。
     
   • 注意：未赔偿前，对方可能申请财产保全，导致车辆被法院扣押，此时需通过诉讼解决赔偿纠纷后才能取车。

4. 办理取车手续

   • 携带身份证、行驶证、驾驶证、交强险保单、事故责任认定书、赔偿凭证（如维修发票、转账记录）或和解书，到交警指定地点办理放车手续。
     
   • 缴纳停车费（若当地规定由财政承担则无需支付，需确认当地政策）。
     
   • 领取《放车通知书》后，凭通知书到停车场提车。

特殊情形处理：

• 若车辆因损坏需维修，可与交警协商将车辆拖至指定修理厂，维修完成后直接提车。
  
• 若对方拒不配合处理（如失联、拒绝和解），可向法院起诉要求确认责任并申请强制执行，凭生效判决书取车。
  

建议：事故后第一时间联系保险公司报案，并保留现场照片、沟通记录等证据，避免因程序疏漏影响取车进度。如有复杂情况（如对方索赔过高、扣车程序违法），可进一步向我说明细节，我会为您分析具体应对方案。