关于地上附着物补偿在长期承包合同中由政府还是企业承担的问题，这主要取决于合同的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 在长期承包合同中，双方通常会就地上附着物的补偿问题作出明确约定。如果合同中明确规定了补偿的责任方（政府或企业），那么应当按照合同约定来执行。
   • 例如：如果合同中约定“在承包期间，如遇政府征收或征用土地，地上附着物的补偿由企业承担”，那么在这种情况下，企业就应当负责地上附着物的补偿。

2. 法律法规的规定：

   • 如果合同中没有明确约定补偿的责任方，或者约定不明确，那么就需要参考相关法律法规的规定。
   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，政府在征收或征用土地时，应当对地上附着物给予合理补偿。但这并不意味着所有情况下都由政府承担补偿责任，因为具体补偿责任还可能受到其他因素（如合同性质、双方约定等）的影响。
   • 特殊情况：如果地上附着物是由企业自行投资建设的，且合同中没有明确约定补偿责任方，那么企业可能会主张由自己承担补偿责任（或至少部分补偿责任），以维护自己的合法权益。这种情况下，可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。

3. 政府与企业共同承担的情况：

   • 在某些特殊情况下，政府和企业可能会共同承担地上附着物的补偿责任。这通常发生在政府和企业之间存在某种合作或共同投资关系，且地上附着物的补偿问题无法单独由一方承担时。
   • 例如：在政府与企业合作开发农村土地的项目中，如果地上附着物是由双方共同投资建设的，那么在征收或征用土地时，政府和企业可能会按照投资比例或其他约定方式共同承担补偿责任。

4. 实际操作建议：

   • 对于承包方来说，在签订长期承包合同时，应当仔细阅读合同条款，特别是关于地上附着物补偿的约定。如果合同中没有明确约定或约定不明确，应当及时与发包方（政府或企业）进行协商，以明确补偿责任方。
   • 在发生征收或征用土地的情况时，承包方应当及时收集相关证据（如合同、投资凭证、地上附着物清单等），以便在争议发生时维护自己的合法权益。

总结来说，地上附着物补偿在长期承包合同中的承担问题并非一成不变，而是需要根据合同的具体约定以及相关法律法规的规定来确定。如果合同中有明确约定，则按照约定执行；如果合同中没有约定或约定不明确，则需要参考相关法律法规的规定，并通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。