核心结论：药店转让后若受让方未配合变更相关手续，您可以通过协商、发送律师函、提起诉讼或向监管部门投诉等途径解决。以下是具体分析和建议：

1. 协商解决

• 法律依据：根据《民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或履行不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任。
• 操作建议：
  • 优先与受让方沟通，明确其不配合的原因（如费用争议、合同条款理解分歧等）。
  • 书面记录协商过程（如邮件、微信聊天记录），保留证据。
  • 若对方提出合理诉求（如转让款未结清），可协商同步履行（如您支付尾款，对方配合变更）。

2. 发送律师函

• 法律依据：律师函具有法律警示作用，可督促对方履行义务，避免诉讼成本。
• 操作建议：
  • 委托律师起草正式律师函，明确要求受让方在指定期限内配合变更（如工商登记、药品经营许可证变更等）。
  • 律师函中应载明违约后果（如赔偿损失、解除合同等）。
  • 通过EMS邮寄律师函，保留寄送凭证。

3. 提起诉讼或仲裁

• 适用情形：协商、律师函均无效，或对方明确拒绝配合。
• 法律依据：
  • 诉讼：依据《民事诉讼法》及转让合同中的管辖条款，向法院起诉要求对方履行变更义务或赔偿损失。
  • 仲裁：若合同约定仲裁条款，可向约定仲裁机构申请仲裁。
• 操作建议：
  • 收集证据：转让合同、付款凭证、协商记录、律师函等。
  • 明确诉讼请求：如要求对方配合变更、支付违约金、赔偿因未变更导致的损失（如停业损失、行政处罚等）。
  • 注意诉讼时效：一般为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。

4. 向监管部门投诉

• 适用情形：受让方不配合变更导致药店无法正常经营（如无法购进药品、面临行政处罚）。
• 操作建议：
  • 向当地市场监管部门、药品监督管理部门投诉，说明受让方拒不配合变更的情况。
  • 监管部门可能介入协调或对受让方进行行政处罚（如罚款、吊销许可证等），倒逼其配合。

5. 合同解除与赔偿

• 法律依据：根据《民法典》第五百六十三条，若对方迟延履行主要债务，经催告后在合理期限内仍未履行，您可解除合同并要求赔偿。
• 操作建议：
  • 若变更手续是合同核心义务（如药品经营许可证变更），且受让方拒不履行，可主张解除合同。
  • 要求受让方返还已支付的转让款，并赔偿因合同解除导致的损失（如装修费用、预期利润等）。

风险提示

• 若未及时办理变更手续，药店可能面临行政处罚（如无证经营），您作为转让方可能需承担连带责任。
• 建议在转让合同中明确约定变更义务、违约责任及争议解决方式，降低后续风险。

如有进一步疑问或需协助处理具体案件，可直接向我咨询。