针对您提出的“医保基金局预付医疗机构医款超额如果不退回需承担的责任”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，医保基金预付给医疗机构是为了帮助其缓解医疗费用垫支压力，提高医疗服务能力，并确保参保人员能够获得及时有效的医疗服务。预付金的使用和管理有着严格的规定和流程，医疗机构必须按照相关规定使用预付金，并确保其用于药品和医用耗材采购等医疗费用周转支出，不得挪作他用。

当医疗机构出现预付金超额且未退回的情况时，这通常被视为违反了预付金使用和管理的相关规定。根据《云南省基本医疗保险基金预付管理办法》以及其他相关医保政策，医疗机构可能需要承担以下责任：

1. 及时退回超额预付金：

   • 医疗机构在发现预付金超额后，应立即与医保经办机构沟通，并尽快退回超额部分。这是医疗机构的基本责任，也是维护医保基金安全的重要措施。

2. 可能面临违约金或罚款：

   • 如果医疗机构逾期未退回超额预付金，医保经办机构有权根据相关规定收取违约金或罚款。具体金额可能根据超额预付金的数额、逾期时间以及医疗机构的违规情节等因素来确定。例如，在丹棱县人民医院的案例中，医院因超医保支付范围使用医保基金被责令退回违约金额，并收取了等额的违约金。

3. 可能影响医保服务协议：

   • 医疗机构若长期或严重违反预付金使用和管理规定，医保经办机构有权中止或解除与其签订的医保服务协议。这将直接影响医疗机构的医保结算和患者就医，对其声誉和运营造成负面影响。

4. 可能面临法律追责：

   • 在极端情况下，如果医疗机构的违规行为涉及欺诈骗保等严重违法犯罪行为，医保部门将依法将其移送司法机关处理。医疗机构及其相关责任人可能面临刑事处罚和民事赔偿等法律责任。

为了避免上述责任的发生，医疗机构应严格遵守预付金使用和管理的相关规定，加强内部管理，确保预付金的合理使用和及时退回。同时，医保经办机构也应加强对医疗机构的监管和指导，确保医保基金的安全和有效使用。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。