结论：丢荒土地被人耕种29年后要收回土地是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及土地权属、承包经营权以及是否存在合法流转等因素。以下从不同角度进行分析：
一、土地权属明确且未流转的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国农村土地承包法》及相关规定，农村土地承包经营权受法律保护，承包方有权依法自主决定土地承包经营权的流转方式。
- 若土地权属明确属于您，且您未将土地承包经营权流转给他人，那么您作为土地承包经营权人，有权收回土地。
实际情况分析：
- 在您丢荒土地期间，若他人未经您同意擅自耕种，这构成对您土地承包经营权的侵犯。
- 无论他人耕种了多长时间，都不能改变土地权属和承包经营权的事实。因此，您有权要求他人停止耕种并返还土地。
二、土地权属明确但存在合法流转的情况
法律依据：
- 若您曾将土地承包经营权流转给他人（如通过出租、转包等方式），并签订了书面流转合同，那么流转期限和条件应受合同约束。
- 在流转期限内，受让方有权按照合同约定使用土地。若流转期限未满，您单方面要求收回土地可能构成违约。
实际情况分析：
- 若您与他人之间存在合法的土地流转关系，且流转期限尚未届满，那么您需要尊重合同约定，不能随意收回土地。
- 若您希望提前收回土地，应与受让方协商解决，并可能需要承担一定的违约责任。
三、土地权属存在争议的情况
法律依据：
- 若土地权属存在争议（如您与他人对土地所有权或承包经营权有争议），那么应先通过行政程序或司法程序确认土地权属。
- 在土地权属确认之前，任何一方都不得擅自改变土地利用现状或侵犯他人的土地权益。
实际情况分析：
- 若您与他人对土地权属存在争议，且争议尚未解决，那么您不能单方面要求收回土地。
- 您应先通过合法途径解决土地权属争议，待争议解决后再根据结果决定是否收回土地。
四、特殊情况：长期丢荒可能导致土地被收回的风险
法律依据：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。
- 若土地长期丢荒，可能面临被村集体或政府收回的风险（具体规定可能因地区而异）。
实际情况分析：
- 虽然您作为土地承包经营权人有权收回被他人擅自耕种的土地，但若土地长期丢荒，也可能引发村集体或政府的干预。
- 因此，建议您在收回土地后，合理规划土地利用，避免再次丢荒。
建议：
- 在采取任何行动之前，先确认土地权属和承包经营权状况，以及是否存在合法的土地流转关系。
- 若与他人存在争议或纠纷，建议通过协商、调解或诉讼等合法途径解决。
- 在收回土地后，合理规划土地利用，遵守相关法律法规和政策规定。
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